More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2031 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  98.51 
 
 
269 aa  550  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  98.51 
 
 
269 aa  550  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  98.88 
 
 
269 aa  552  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  98.51 
 
 
269 aa  550  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  98.51 
 
 
269 aa  551  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  98.51 
 
 
269 aa  550  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  98.14 
 
 
269 aa  548  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  97.77 
 
 
269 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  69.14 
 
 
269 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  69.14 
 
 
269 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  69.14 
 
 
269 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  68.77 
 
 
269 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  65.8 
 
 
269 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  65.17 
 
 
271 aa  346  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  57.89 
 
 
265 aa  301  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53.01 
 
 
267 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53.96 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53.96 
 
 
265 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  52.26 
 
 
267 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  56.23 
 
 
268 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.85 
 
 
268 aa  265  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.47 
 
 
268 aa  264  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.76 
 
 
267 aa  241  9e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  42.31 
 
 
271 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.46 
 
 
268 aa  205  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  39.1 
 
 
273 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  38.37 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.5 
 
 
277 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.37 
 
 
268 aa  178  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.2 
 
 
271 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  38.52 
 
 
269 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  39.84 
 
 
278 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  36.57 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  37.93 
 
 
269 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  38.26 
 
 
277 aa  168  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  37.16 
 
 
269 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  39.67 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 
269 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  37.16 
 
 
269 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  38.58 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.35 
 
 
269 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.96 
 
 
269 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35 
 
 
276 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  35.21 
 
 
300 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  37.98 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  37.6 
 
 
269 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  38.37 
 
 
277 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.78 
 
 
271 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.96 
 
 
271 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.02 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.37 
 
 
282 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  36.82 
 
 
296 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  35.51 
 
 
288 aa  145  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.87 
 
 
271 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.8 
 
 
271 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.87 
 
 
271 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  36.95 
 
 
271 aa  142  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  34.12 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.4 
 
 
271 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.8 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  34.18 
 
 
271 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.66 
 
 
271 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.1 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.11 
 
 
271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.14 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  32.57 
 
 
268 aa  125  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  31.6 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  31.84 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  37.11 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  32.07 
 
 
277 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  32.07 
 
 
277 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1632  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  30.6 
 
 
289 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.114958  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  25.79 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 
287 aa  96.3  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  26.19 
 
 
291 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  27.71 
 
 
281 aa  95.9  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  25.79 
 
 
291 aa  95.5  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  31.45 
 
 
272 aa  95.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  27.87 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  25.79 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  26.94 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  31.88 
 
 
264 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  26.4 
 
 
246 aa  94  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  25.4 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  25.4 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  26.19 
 
 
291 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  28.33 
 
 
287 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  31.82 
 
 
288 aa  93.2  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  25.79 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 
292 aa  92  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  27.71 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  28.21 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  25.4 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  27.47 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  28.85 
 
 
310 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  29.57 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.77 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  27.65 
 
 
291 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>