More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1909 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 
265 aa  545  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  64.53 
 
 
265 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  64.53 
 
 
265 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  61.89 
 
 
267 aa  343  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  58.87 
 
 
267 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  61.51 
 
 
268 aa  319  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  61.13 
 
 
268 aa  318  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  61.13 
 
 
268 aa  317  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  58.27 
 
 
269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  57.52 
 
 
269 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  57.89 
 
 
269 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  57.52 
 
 
269 aa  301  9e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  57.52 
 
 
269 aa  301  9e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  57.52 
 
 
269 aa  301  9e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  57.52 
 
 
269 aa  301  9e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.09 
 
 
269 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  57.52 
 
 
269 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.09 
 
 
269 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.09 
 
 
269 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  54.72 
 
 
269 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  54.72 
 
 
269 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  56.6 
 
 
269 aa  298  5e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53.58 
 
 
271 aa  275  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  48.68 
 
 
267 aa  272  5.000000000000001e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.63 
 
 
268 aa  218  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  43.67 
 
 
271 aa  218  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.8 
 
 
271 aa  208  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  42.02 
 
 
278 aa  206  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  42.74 
 
 
277 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  39.43 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  38.55 
 
 
269 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.52 
 
 
277 aa  185  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  39.62 
 
 
269 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  39.29 
 
 
269 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  38.7 
 
 
271 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  39.29 
 
 
269 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  38.87 
 
 
269 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  38.87 
 
 
269 aa  178  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.55 
 
 
268 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  38.89 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  38.89 
 
 
269 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.49 
 
 
269 aa  175  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  39.06 
 
 
273 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  36.97 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  37.01 
 
 
277 aa  165  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  38.46 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.23 
 
 
271 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.5 
 
 
271 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.88 
 
 
271 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.08 
 
 
271 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.26 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.02 
 
 
282 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  40.49 
 
 
285 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  39.75 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  37.05 
 
 
288 aa  152  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.55 
 
 
271 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.85 
 
 
276 aa  148  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.05 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.5 
 
 
271 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  37.1 
 
 
296 aa  145  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.05 
 
 
271 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  37.97 
 
 
271 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  34.48 
 
 
275 aa  141  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.64 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.36 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.25 
 
 
271 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  32.26 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  36.65 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  35.9 
 
 
272 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.4 
 
 
268 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.21 
 
 
271 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  33.62 
 
 
277 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  33.62 
 
 
277 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  28.25 
 
 
298 aa  99.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 
287 aa  96.3  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  34.18 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  30.2 
 
 
310 aa  93.6  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.84 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  27.45 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  32.7 
 
 
287 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  28.46 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  31.42 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  31.56 
 
 
285 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  34.13 
 
 
264 aa  91.3  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  28.16 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  28.29 
 
 
286 aa  89  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  31.21 
 
 
285 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  27.86 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  28.22 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  27.92 
 
 
298 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  27.92 
 
 
298 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  28.97 
 
 
280 aa  86.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  27.92 
 
 
298 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 
287 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  27.92 
 
 
298 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  27.92 
 
 
298 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  27.92 
 
 
298 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  27.92 
 
 
298 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  32.22 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>