More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1297 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 
269 aa  560  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  99.63 
 
 
269 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  99.63 
 
 
269 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  98.88 
 
 
269 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  80.67 
 
 
269 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  69.52 
 
 
269 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  69.89 
 
 
269 aa  401  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  69.52 
 
 
269 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  69.52 
 
 
269 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  69.52 
 
 
269 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  69.52 
 
 
269 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  68.77 
 
 
269 aa  398  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  69.14 
 
 
269 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  69.14 
 
 
269 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  66.67 
 
 
271 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  54.51 
 
 
267 aa  305  7e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  55.09 
 
 
265 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53.76 
 
 
267 aa  295  6e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  52.08 
 
 
265 aa  292  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  52.45 
 
 
265 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  56.6 
 
 
268 aa  279  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  56.23 
 
 
268 aa  278  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  56.6 
 
 
268 aa  278  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  48.12 
 
 
267 aa  257  1e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  42.04 
 
 
271 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.52 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  41.38 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  37.79 
 
 
278 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.84 
 
 
268 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  34.88 
 
 
271 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  41.2 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  40.7 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  35.97 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  36.12 
 
 
277 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  37.94 
 
 
269 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  35.43 
 
 
271 aa  168  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.02 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.25 
 
 
277 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  37.15 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  37.15 
 
 
269 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  37.15 
 
 
269 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  35.02 
 
 
269 aa  158  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  34.63 
 
 
269 aa  158  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  37.96 
 
 
277 aa  155  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  34.24 
 
 
269 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.85 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.85 
 
 
271 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  35.14 
 
 
288 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.51 
 
 
271 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  33.2 
 
 
275 aa  148  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.93 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.25 
 
 
271 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.11 
 
 
271 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  31.1 
 
 
300 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.92 
 
 
271 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  35.22 
 
 
296 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  37.6 
 
 
271 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.73 
 
 
271 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.55 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.11 
 
 
271 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.11 
 
 
271 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35 
 
 
271 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.46 
 
 
271 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.97 
 
 
270 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.28 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  33.47 
 
 
269 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  30.12 
 
 
295 aa  122  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.61 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1632  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  29.17 
 
 
289 aa  105  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.114958  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  32.65 
 
 
271 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  31.12 
 
 
277 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  31.12 
 
 
277 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  30.65 
 
 
272 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  26.21 
 
 
298 aa  95.9  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  31 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  23.72 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  28.76 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.52 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  28.76 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0329  aminotransferase, class IV  27.16 
 
 
315 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  26.34 
 
 
310 aa  89.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  26.56 
 
 
299 aa  89.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  29.32 
 
 
280 aa  88.6  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  25.32 
 
 
295 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0141  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  25.17 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.186701  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  24.39 
 
 
246 aa  87  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  32.66 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  28.34 
 
 
300 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  24.08 
 
 
298 aa  85.5  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  22.76 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2383  aminotransferase class IV  26.75 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  23.69 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.18 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  24.3 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  24.69 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  24.69 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  23.69 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  29.46 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  23.69 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>