More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0329 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0329  aminotransferase, class IV  100 
 
 
315 aa  639    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2383  aminotransferase class IV  79.87 
 
 
313 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0255  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  65.18 
 
 
313 aa  431  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1107  aminotransferase class IV  52.4 
 
 
314 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.0333795 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1756  aminotransferase class IV  51.59 
 
 
316 aa  322  7e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.336644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2275  aminotransferase class IV  53 
 
 
320 aa  315  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.337005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3207  aminotransferase, class IV  39.22 
 
 
325 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  34.44 
 
 
288 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  31.48 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  30.2 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  32.12 
 
 
295 aa  146  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  31.82 
 
 
292 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  32.21 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  30.6 
 
 
295 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  30.2 
 
 
299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  31.34 
 
 
289 aa  139  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  32.09 
 
 
297 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  32.31 
 
 
347 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  30.48 
 
 
292 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  32.42 
 
 
297 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  31.76 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  31.76 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  31.76 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  31.76 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  31.76 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  31.76 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  30.35 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  31.76 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  31.76 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  31.76 
 
 
299 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  31.6 
 
 
288 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 
288 aa  133  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  31.72 
 
 
303 aa  133  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  31.37 
 
 
299 aa  132  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  30.98 
 
 
299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29.57 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  29.57 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  29.57 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  29.57 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  29.57 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  29.57 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.57 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  29.57 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  29.25 
 
 
298 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  30.2 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  29.52 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  27.65 
 
 
293 aa  129  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  30.86 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  30.08 
 
 
292 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  30.37 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  30.28 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 
299 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  29.88 
 
 
287 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43558  predicted protein  34.28 
 
 
304 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0165019 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  31.4 
 
 
288 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  28.69 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  28.29 
 
 
286 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  27.09 
 
 
286 aa  109  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
306 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  28.74 
 
 
309 aa  102  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  30.62 
 
 
287 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  29.5 
 
 
306 aa  99  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  28 
 
 
311 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  27.95 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  30.65 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  28.31 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  30.62 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  27.72 
 
 
306 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  29.84 
 
 
287 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 
307 aa  95.9  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  27.62 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  30.92 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  29.81 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  31.18 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  27.05 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  29.23 
 
 
287 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  27.37 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  30.29 
 
 
305 aa  93.2  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  30.34 
 
 
298 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  28.74 
 
 
319 aa  92.8  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.33 
 
 
267 aa  92.4  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  26.95 
 
 
307 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  30.8 
 
 
304 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  29.41 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  29.64 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  29.46 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50806  predicted protein  26.49 
 
 
588 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  27.86 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  31.25 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  27.48 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.16 
 
 
269 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  26.21 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  27 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  30.08 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  28.36 
 
 
295 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.16 
 
 
269 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.16 
 
 
269 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.16 
 
 
269 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 
308 aa  89.4  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>