More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1921 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
300 aa  619  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  51 
 
 
271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  47.14 
 
 
269 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  48.31 
 
 
269 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  47.97 
 
 
269 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  47.64 
 
 
269 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  47.97 
 
 
269 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.47 
 
 
269 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  48.15 
 
 
269 aa  262  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  49 
 
 
271 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  47.47 
 
 
269 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  47.47 
 
 
269 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  47.04 
 
 
277 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  45.36 
 
 
294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  40.2 
 
 
277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  40.89 
 
 
296 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  36.63 
 
 
271 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.97 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.45 
 
 
267 aa  160  3e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.51 
 
 
269 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.86 
 
 
269 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  34.86 
 
 
269 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.21 
 
 
269 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.33 
 
 
268 aa  155  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.54 
 
 
269 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.22 
 
 
271 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.86 
 
 
269 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.51 
 
 
269 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.51 
 
 
269 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.51 
 
 
269 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  34.51 
 
 
269 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  35.21 
 
 
285 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.74 
 
 
276 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.93 
 
 
265 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  34.78 
 
 
288 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.33 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.99 
 
 
265 aa  146  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.1 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.65 
 
 
271 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.74 
 
 
269 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.74 
 
 
269 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.74 
 
 
269 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.63 
 
 
271 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.93 
 
 
277 aa  142  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.72 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.76 
 
 
271 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  31.03 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.18 
 
 
268 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.44 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.49 
 
 
271 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  32.52 
 
 
273 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.22 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  30.29 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.26 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.41 
 
 
271 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.18 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.99 
 
 
271 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.53 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.74 
 
 
271 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.69 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.14 
 
 
282 aa  122  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.73 
 
 
268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.02 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31 
 
 
268 aa  118  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  30.72 
 
 
275 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  30.08 
 
 
271 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  30.63 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  25.9 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1632  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  29.02 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.114958  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  30.31 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  25 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  27.57 
 
 
269 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 
272 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  27.9 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  27.1 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  27.1 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  25.09 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  25.16 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  26.13 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.09 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  26.13 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  23.1 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1220  aminotransferase class IV  25.94 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  25.09 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  25.08 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0121  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase-like protein  27.99 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  23.32 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  23.32 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  25.61 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  25.61 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  23.74 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  23.13 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  43 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  24.11 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  24.21 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  24.44 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  24.35 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0141  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  26.14 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.186701  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  23.86 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  20.14 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>