More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1502 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  100 
 
 
271 aa  552  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.1 
 
 
271 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  48.65 
 
 
271 aa  232  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.1 
 
 
271 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.88 
 
 
271 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  46.18 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.13 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  46.74 
 
 
271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  46.33 
 
 
271 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  46.24 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.51 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  44.57 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.56 
 
 
271 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  42.26 
 
 
273 aa  205  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.51 
 
 
271 aa  205  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  42.32 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  43.15 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.36 
 
 
276 aa  175  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  40.82 
 
 
271 aa  162  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.34 
 
 
265 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.97 
 
 
269 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.3 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.59 
 
 
269 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.59 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.89 
 
 
271 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.71 
 
 
269 aa  149  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  39.16 
 
 
277 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  39.16 
 
 
277 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  35.57 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.44 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  32.96 
 
 
271 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.97 
 
 
265 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  34.56 
 
 
271 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.44 
 
 
267 aa  143  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.02 
 
 
269 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  32.02 
 
 
278 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  34.6 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  34.55 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.18 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.18 
 
 
269 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.18 
 
 
269 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  34.18 
 
 
269 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.73 
 
 
268 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.18 
 
 
269 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.66 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.86 
 
 
269 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.18 
 
 
269 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.82 
 
 
268 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.46 
 
 
269 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.82 
 
 
268 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.76 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  32.94 
 
 
294 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  34.43 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.07 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.07 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.07 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.02 
 
 
267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  35.16 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.55 
 
 
277 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  29.7 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  30.97 
 
 
269 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  33.76 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  30.97 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  30.97 
 
 
269 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  30.97 
 
 
269 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.69 
 
 
271 aa  126  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  35.15 
 
 
269 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  31.09 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.2 
 
 
268 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.99 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  30.08 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  31.84 
 
 
288 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  28.41 
 
 
293 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  30.71 
 
 
295 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.21 
 
 
290 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.21 
 
 
290 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.21 
 
 
290 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.21 
 
 
290 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  33.67 
 
 
305 aa  106  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  29.54 
 
 
310 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.46 
 
 
277 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  25.89 
 
 
293 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.79 
 
 
290 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 
297 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 
295 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 
298 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 
287 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 
298 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 
298 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 
298 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 
298 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 
298 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 
298 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  32.02 
 
 
296 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  29.25 
 
 
281 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 
298 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  30.38 
 
 
287 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 
298 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.69 
 
 
290 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 
299 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>