More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2383 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2383  aminotransferase class IV  100 
 
 
313 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0329  aminotransferase, class IV  79.87 
 
 
315 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0255  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  65.81 
 
 
313 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1107  aminotransferase class IV  51.61 
 
 
314 aa  331  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.0333795 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1756  aminotransferase class IV  52.26 
 
 
316 aa  325  7e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.336644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2275  aminotransferase class IV  48.44 
 
 
320 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.337005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3207  aminotransferase, class IV  39.35 
 
 
325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  34.69 
 
 
288 aa  149  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 
297 aa  143  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  32.46 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  31.62 
 
 
291 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  30.6 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 
299 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 
299 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 
299 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 
299 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 
299 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 
299 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 
299 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 
299 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 
299 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  28.24 
 
 
293 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  30.3 
 
 
292 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  31.13 
 
 
293 aa  136  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  31.25 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  30.97 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  29.26 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  29.85 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  31.37 
 
 
298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  31.2 
 
 
347 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  30.86 
 
 
297 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  31.7 
 
 
303 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  29.34 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  29.73 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  28.74 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  29.85 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 
293 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
298 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
298 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
298 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
298 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  27.07 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  29.85 
 
 
288 aa  125  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  31.15 
 
 
287 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  29.52 
 
 
298 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  28.31 
 
 
299 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
298 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  30.62 
 
 
288 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  27.68 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  29.62 
 
 
287 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  28.47 
 
 
293 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43558  predicted protein  31.43 
 
 
304 aa  115  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0165019 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  29.17 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  26.54 
 
 
286 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  28.74 
 
 
282 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  30.66 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  30.23 
 
 
287 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  30.23 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  29.73 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  28.74 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.92 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  28.84 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  25.1 
 
 
291 aa  89.4  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  29.07 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2045  aminotransferase class IV  26.85 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  hitchhiker  0.00531754 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  28.46 
 
 
287 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  27.31 
 
 
306 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  29.24 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.99 
 
 
267 aa  86.7  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  30.19 
 
 
286 aa  86.3  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  28.68 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  25.86 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  29.25 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.75 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.75 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  28.41 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.02 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.75 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2355  aminotransferase class IV  27.84 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  25.77 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  27.03 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  29.67 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.75 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.92 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  25.38 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50806  predicted protein  26.16 
 
 
588 aa  83.6  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  28.85 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  28.69 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  30.74 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  26.24 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  28.52 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  25.38 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  29.18 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  34.03 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>