More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50806 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_50806  predicted protein  100 
 
 
588 aa  1224    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5244  aminotransferase class IV  38.87 
 
 
317 aa  223  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2699  aminotransferase class IV  37.21 
 
 
305 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1215  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  40.26 
 
 
299 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2876  aminotransferase, class IV  40.26 
 
 
299 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4206  aminotransferase class IV  39.6 
 
 
307 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  40.85 
 
 
297 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2653  aminotransferase, class IV  38.94 
 
 
299 aa  198  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0838817  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  37.68 
 
 
289 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2852  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.61 
 
 
308 aa  194  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  37.63 
 
 
292 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  39.02 
 
 
293 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
291 aa  191  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  39.07 
 
 
292 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  36.01 
 
 
347 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  34.51 
 
 
288 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  36.84 
 
 
288 aa  182  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  37.63 
 
 
299 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 
299 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 
299 aa  180  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 
293 aa  180  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 
299 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 
299 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 
299 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 
299 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 
299 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 
299 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 
299 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  36.49 
 
 
303 aa  179  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  36.14 
 
 
299 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 
297 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  34.86 
 
 
297 aa  177  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  36.14 
 
 
287 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  36.49 
 
 
287 aa  173  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  36.9 
 
 
288 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  35.89 
 
 
293 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  37.93 
 
 
295 aa  171  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  36.14 
 
 
287 aa  171  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  36.24 
 
 
292 aa  166  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  34.01 
 
 
290 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  35.44 
 
 
286 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  35.94 
 
 
292 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  35.09 
 
 
286 aa  162  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  35.29 
 
 
295 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  33.68 
 
 
299 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  32.42 
 
 
298 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  32.63 
 
 
298 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  32.63 
 
 
298 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  31.74 
 
 
298 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  32.63 
 
 
298 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  32.63 
 
 
298 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  32.28 
 
 
298 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  32.28 
 
 
298 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  32.28 
 
 
298 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  32.28 
 
 
298 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  36.43 
 
 
282 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  35.31 
 
 
288 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  33.93 
 
 
293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  31.65 
 
 
299 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  35.31 
 
 
306 aa  152  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  34.34 
 
 
306 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  34.16 
 
 
309 aa  151  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  34.51 
 
 
307 aa  150  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  32.86 
 
 
307 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  32.23 
 
 
299 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  33.67 
 
 
292 aa  148  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
309 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  32.5 
 
 
307 aa  147  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  35.59 
 
 
306 aa  146  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  33.45 
 
 
311 aa  146  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  34.7 
 
 
307 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 
307 aa  145  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  34.48 
 
 
310 aa  144  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  33.57 
 
 
307 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  33.57 
 
 
307 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  34.16 
 
 
306 aa  144  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  32.74 
 
 
307 aa  143  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  32.74 
 
 
307 aa  143  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  34.4 
 
 
307 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  33.81 
 
 
306 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  34.35 
 
 
308 aa  139  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  34.16 
 
 
304 aa  138  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  33 
 
 
306 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  32.51 
 
 
307 aa  139  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 
317 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  32.66 
 
 
306 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  34.38 
 
 
307 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  34.09 
 
 
307 aa  136  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  33.81 
 
 
304 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  31.49 
 
 
305 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  34.09 
 
 
307 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  34.27 
 
 
303 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  33.81 
 
 
304 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  32.01 
 
 
308 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  32.01 
 
 
308 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  32.32 
 
 
306 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  32.01 
 
 
308 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
302 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  32.84 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  32.43 
 
 
311 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>