More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2355 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2355  aminotransferase class IV  100 
 
 		 281 aa  563  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0662  aminotransferase class IV  56.68 
 
 		 280 aa  323  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233198  normal  0.531418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5563  aminotransferase class IV  36.75 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3559  aminotransferase class IV  36.94 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.089993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2045  aminotransferase class IV  34.22 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  hitchhiker  0.00531754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  29.14 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  27.9 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  30.58 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  30.58 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  28.78 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  30.58 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  30.58 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  28.07 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  30.58 
 
 		 294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  30.58 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  30.58 
 
 		 290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  30.32 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  29.03 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  30.8 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  30.04 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  32.23 
 
 		 288 aa  125  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  30.29 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  29.09 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  27.44 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  27.44 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  27.44 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  28.67 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  31.52 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  27.96 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  31.5 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  30.94 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  31.07 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  27.96 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  27.08 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  27.08 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  30.39 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  28.11 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  28.11 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  28.11 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  28.11 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  28.11 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  27.08 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  31.65 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  31.8 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  28.06 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  27.08 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  29.78 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  27.6 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  27.6 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  29.71 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  27.6 
 
 		 298 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  27.6 
 
 		 298 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  28.73 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  27.6 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  28.11 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  29.86 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  30.29 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  28.42 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  26.55 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  28.52 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  27.17 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  30.63 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  28.52 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  28.41 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 		 306 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  28.31 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  28.78 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.73 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  27.74 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  29.41 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  30.29 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.85 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  28.77 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  29.39 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  27.17 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  31.94 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  27.37 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  30.48 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  29.71 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  29.24 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  26.79 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  26.79 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  30.77 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  31.02 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>