More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5563 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5563  aminotransferase class IV  100 
 
 
283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3559  aminotransferase class IV  48.75 
 
 
276 aa  278  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.089993  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2355  aminotransferase class IV  36.75 
 
 
281 aa  205  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2045  aminotransferase class IV  37.82 
 
 
279 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  hitchhiker  0.00531754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0662  aminotransferase class IV  33.33 
 
 
280 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233198  normal  0.531418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  31.38 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  30.88 
 
 
291 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  30.9 
 
 
291 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  30.56 
 
 
298 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  30.56 
 
 
298 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
299 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  30.24 
 
 
291 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 
299 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
299 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  30.56 
 
 
298 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  30.56 
 
 
298 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  30.56 
 
 
298 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  30.56 
 
 
298 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  30.56 
 
 
298 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  30.56 
 
 
298 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  30.56 
 
 
298 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
299 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
299 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
299 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
299 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
299 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
299 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
299 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  30.53 
 
 
291 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  29.31 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  31.96 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  29.86 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  30.53 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  29.66 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  29.62 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  30.53 
 
 
291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  30.53 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 
299 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  28.97 
 
 
295 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  30.8 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  31.38 
 
 
292 aa  115  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  30.39 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  30.21 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  30.8 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  29.31 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0257  aminotransferase class IV  31.06 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  29.07 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  29.23 
 
 
299 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  27.59 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  27.59 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4955  aminotransferase class IV  28.08 
 
 
496 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0111871 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  29.97 
 
 
287 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3053  aminotransferase, class IV  28.08 
 
 
496 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5314  aminotransferase, class IV  28.08 
 
 
317 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  29.97 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  27.97 
 
 
291 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  29.33 
 
 
288 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  29.24 
 
 
294 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  28.82 
 
 
287 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  27.34 
 
 
292 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  29.97 
 
 
287 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.24 
 
 
282 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  29.26 
 
 
283 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  26.21 
 
 
288 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0068  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.55 
 
 
291 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  28.62 
 
 
286 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  29.07 
 
 
347 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  28.28 
 
 
292 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  29.76 
 
 
286 aa  102  7e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  28.12 
 
 
298 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  29.07 
 
 
286 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  29.27 
 
 
295 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  27.97 
 
 
286 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  28.98 
 
 
286 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  26.74 
 
 
300 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.37 
 
 
277 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  29.27 
 
 
286 aa  99.4  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  27.85 
 
 
310 aa  99  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.69 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  28.98 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  26.85 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  28.84 
 
 
290 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  28.84 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  28.84 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  28.68 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  28.46 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  29.55 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.87 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  27.87 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  28.46 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  28.09 
 
 
290 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  27.24 
 
 
285 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  28.46 
 
 
290 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  29.55 
 
 
307 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  28.22 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>