More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1421 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
347 aa  701    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  78.05 
 
 
289 aa  471  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  77.08 
 
 
288 aa  472  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  76.66 
 
 
297 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  67.01 
 
 
292 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  65.76 
 
 
297 aa  411  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  67.13 
 
 
303 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  65.28 
 
 
292 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  55.36 
 
 
297 aa  334  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  55.71 
 
 
292 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  54.67 
 
 
293 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  54.33 
 
 
299 aa  321  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  53.98 
 
 
293 aa  319  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  52.08 
 
 
293 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  53.66 
 
 
292 aa  311  7.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  53.93 
 
 
287 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  54.64 
 
 
287 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  50.53 
 
 
295 aa  309  4e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  50.52 
 
 
299 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  50.87 
 
 
286 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  52.25 
 
 
286 aa  301  9e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  52.86 
 
 
287 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  53.29 
 
 
288 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  50.87 
 
 
299 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  51.59 
 
 
299 aa  298  9e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  51.59 
 
 
299 aa  298  9e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  51.59 
 
 
299 aa  298  9e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  51.59 
 
 
299 aa  298  9e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  51.59 
 
 
299 aa  298  9e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  51.59 
 
 
299 aa  298  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  51.59 
 
 
299 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  51.59 
 
 
299 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  51.59 
 
 
299 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  51.59 
 
 
299 aa  296  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 
290 aa  295  6e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  50.35 
 
 
293 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  49.13 
 
 
298 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  49.13 
 
 
298 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  49.48 
 
 
298 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  49.13 
 
 
298 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  49.13 
 
 
298 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  49.13 
 
 
298 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  49.13 
 
 
298 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  49.13 
 
 
298 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  49.13 
 
 
298 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  50.53 
 
 
299 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  48.96 
 
 
291 aa  292  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  48.79 
 
 
298 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  49.47 
 
 
288 aa  284  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
295 aa  282  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  47.7 
 
 
288 aa  255  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  45.71 
 
 
282 aa  253  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  43.97 
 
 
311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  44.06 
 
 
307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 
307 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  42.71 
 
 
304 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  41.18 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  42.71 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  41.87 
 
 
307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  41.32 
 
 
308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  40.91 
 
 
306 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  44.52 
 
 
307 aa  212  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  42.71 
 
 
308 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 
307 aa  212  9e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  39.08 
 
 
319 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  42.36 
 
 
308 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  41.9 
 
 
308 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  41.28 
 
 
319 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  42.71 
 
 
307 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  42.36 
 
 
308 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  40.68 
 
 
307 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  40.68 
 
 
307 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  42.01 
 
 
307 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  42.76 
 
 
317 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  40.93 
 
 
308 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  42.11 
 
 
307 aa  208  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  42.5 
 
 
306 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  39.66 
 
 
306 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 
307 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  41.87 
 
 
308 aa  206  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  43.62 
 
 
306 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  41.26 
 
 
306 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  43.25 
 
 
308 aa  206  7e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  40.28 
 
 
308 aa  205  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  41.28 
 
 
312 aa  205  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  40.28 
 
 
308 aa  205  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  40.28 
 
 
308 aa  205  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 
309 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 
309 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 
307 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 
309 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 
309 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 
309 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 
309 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  40.83 
 
 
309 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 
309 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  40.62 
 
 
309 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  40.56 
 
 
307 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 
307 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 
309 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>