More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1306 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
297 aa  600  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  73.08 
 
 
289 aa  437  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  70.38 
 
 
288 aa  431  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  70.14 
 
 
292 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  68.42 
 
 
297 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  68.4 
 
 
292 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  66.9 
 
 
347 aa  408  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  66.08 
 
 
303 aa  392  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  60.34 
 
 
293 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  61.59 
 
 
297 aa  351  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  56.9 
 
 
293 aa  342  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  58.42 
 
 
291 aa  340  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  57.64 
 
 
292 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  56.99 
 
 
299 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  56.29 
 
 
299 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  56.29 
 
 
299 aa  329  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  56.29 
 
 
299 aa  329  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  56.29 
 
 
299 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  56.29 
 
 
299 aa  329  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  55.94 
 
 
299 aa  329  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  56.29 
 
 
299 aa  329  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  55.59 
 
 
299 aa  329  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  56.29 
 
 
299 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  54.83 
 
 
293 aa  328  6e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  56.6 
 
 
292 aa  328  7e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  55.94 
 
 
299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  55.75 
 
 
299 aa  326  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  52.04 
 
 
299 aa  318  9e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  57.4 
 
 
287 aa  317  1e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  56.68 
 
 
287 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  52.96 
 
 
299 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  52.96 
 
 
286 aa  310  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  53.58 
 
 
295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  55.56 
 
 
295 aa  306  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  52.41 
 
 
293 aa  305  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  53.31 
 
 
286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  51.56 
 
 
298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  50.52 
 
 
298 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  50.52 
 
 
298 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  50.52 
 
 
298 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  50.52 
 
 
298 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  50.52 
 
 
298 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  50.52 
 
 
298 aa  301  9e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  50.52 
 
 
298 aa  301  9e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 
298 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  52.43 
 
 
290 aa  300  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 
298 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  53.15 
 
 
288 aa  298  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  51.41 
 
 
288 aa  293  3e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  52.3 
 
 
288 aa  280  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  47.14 
 
 
282 aa  263  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  44.44 
 
 
311 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  43.66 
 
 
307 aa  224  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  44.13 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  44.13 
 
 
309 aa  218  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  41.99 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  41.99 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  40.14 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  43.26 
 
 
307 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  41.52 
 
 
302 aa  216  5e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  41.3 
 
 
309 aa  216  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  42.16 
 
 
339 aa  215  7e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  41.32 
 
 
319 aa  215  8e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  42.07 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 
306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  42.76 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  40.89 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  42.21 
 
 
307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  42.5 
 
 
306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  40.93 
 
 
308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  43.77 
 
 
308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 
306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  41.32 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 
308 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 
308 aa  212  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 
307 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  43.77 
 
 
308 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  41.84 
 
 
318 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  41.28 
 
 
308 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  45.21 
 
 
312 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  39.08 
 
 
307 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 
308 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 
308 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 
308 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  40.93 
 
 
308 aa  209  6e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  40.49 
 
 
307 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  41.58 
 
 
303 aa  208  7e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  41.24 
 
 
319 aa  208  8e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
308 aa  208  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 
309 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 
309 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 
309 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 
309 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 
309 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  42.35 
 
 
309 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 
309 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 
309 aa  208  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>