More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1546 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
287 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  94.43 
 
 
287 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  93.73 
 
 
287 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  85.92 
 
 
286 aa  489  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  80.28 
 
 
286 aa  464  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  59.35 
 
 
297 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  58.93 
 
 
292 aa  334  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  56.84 
 
 
292 aa  332  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  56.25 
 
 
292 aa  331  7.000000000000001e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  56.84 
 
 
289 aa  330  1e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  56.49 
 
 
288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  56.14 
 
 
293 aa  325  7e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  55.79 
 
 
297 aa  323  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  56.18 
 
 
292 aa  322  6e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  56.16 
 
 
299 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  54.32 
 
 
293 aa  311  5.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  53.12 
 
 
291 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  56.16 
 
 
299 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  53.52 
 
 
299 aa  308  5.9999999999999995e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  52.88 
 
 
293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  53.12 
 
 
298 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  53.12 
 
 
298 aa  306  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  53.12 
 
 
298 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  52.78 
 
 
298 aa  306  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  53.12 
 
 
298 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  53.12 
 
 
298 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  52.78 
 
 
298 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  53 
 
 
299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  53 
 
 
299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  53 
 
 
299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  53 
 
 
299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  52.78 
 
 
298 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  53 
 
 
299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  52.78 
 
 
298 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  53 
 
 
299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  52.65 
 
 
299 aa  305  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  53 
 
 
299 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  54.48 
 
 
295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  52.65 
 
 
299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  52.65 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  52.43 
 
 
298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  51.94 
 
 
299 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  52.86 
 
 
347 aa  300  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  52.16 
 
 
293 aa  298  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  52.69 
 
 
288 aa  295  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  53.33 
 
 
288 aa  294  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 
303 aa  288  7e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  49.47 
 
 
290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  48.77 
 
 
288 aa  280  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  50.36 
 
 
295 aa  278  7e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  48.39 
 
 
282 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  47.54 
 
 
304 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  47.35 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  46.83 
 
 
304 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  46.48 
 
 
304 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  42.95 
 
 
307 aa  228  8e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  43.69 
 
 
307 aa  228  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  42.18 
 
 
311 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.06 
 
 
305 aa  225  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  43.36 
 
 
307 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  43.1 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  40.74 
 
 
306 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  42.66 
 
 
307 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  42.61 
 
 
306 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  43.88 
 
 
306 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  42.18 
 
 
308 aa  216  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  42.31 
 
 
307 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  43 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  42.03 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  40.96 
 
 
312 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  39.59 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  42.86 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  40.34 
 
 
309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  42.61 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  39.25 
 
 
312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 
303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
302 aa  212  5.999999999999999e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  40.61 
 
 
307 aa  212  5.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
309 aa  211  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  44.48 
 
 
309 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  42.27 
 
 
305 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.93 
 
 
308 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  41.84 
 
 
307 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  42.18 
 
 
307 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  41.84 
 
 
307 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 
309 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  42.31 
 
 
307 aa  210  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  41.84 
 
 
307 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  41.84 
 
 
307 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 
312 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  41.84 
 
 
307 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
309 aa  208  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  42.37 
 
 
309 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  41.5 
 
 
307 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  39.02 
 
 
307 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  40.56 
 
 
313 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  40.82 
 
 
307 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>