More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0182 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  98.4 
 
 
312 aa  643    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
312 aa  652    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  89.74 
 
 
312 aa  607  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  89.42 
 
 
312 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  87.18 
 
 
312 aa  589  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  85.94 
 
 
313 aa  582  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  83.28 
 
 
317 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  82.59 
 
 
316 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  82.43 
 
 
313 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  82.35 
 
 
307 aa  546  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  83.45 
 
 
296 aa  535  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  71.99 
 
 
307 aa  474  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  72.31 
 
 
307 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  72.31 
 
 
307 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  72.31 
 
 
307 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  71.66 
 
 
307 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  71.01 
 
 
307 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  71.01 
 
 
307 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  70.68 
 
 
307 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  70.68 
 
 
307 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  70.68 
 
 
307 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  70.68 
 
 
307 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  70.03 
 
 
307 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  70.68 
 
 
307 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  70.68 
 
 
307 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  70.68 
 
 
307 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  70.68 
 
 
307 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  70.68 
 
 
307 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  70.03 
 
 
307 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  69.93 
 
 
306 aa  458  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  68.3 
 
 
309 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  68.3 
 
 
306 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  66.67 
 
 
306 aa  441  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  66.01 
 
 
306 aa  434  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  66.34 
 
 
307 aa  433  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  62.34 
 
 
308 aa  431  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  63.4 
 
 
307 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  64.14 
 
 
306 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  64.05 
 
 
307 aa  428  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  63.4 
 
 
310 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  63.4 
 
 
307 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  64.05 
 
 
306 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  63.07 
 
 
307 aa  425  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  63.73 
 
 
307 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  61.84 
 
 
311 aa  420  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  62.75 
 
 
307 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  62.01 
 
 
309 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  62.09 
 
 
307 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  62.09 
 
 
307 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  62.09 
 
 
306 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  61.11 
 
 
307 aa  408  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  60.26 
 
 
309 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  60.46 
 
 
305 aa  403  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  59.48 
 
 
306 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  60.66 
 
 
305 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  58.36 
 
 
309 aa  397  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  58.69 
 
 
309 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  61.11 
 
 
306 aa  397  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  58.31 
 
 
309 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  56.77 
 
 
307 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  55.08 
 
 
307 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  54.1 
 
 
307 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  53.77 
 
 
307 aa  359  4e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  54.73 
 
 
306 aa  355  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  53.14 
 
 
307 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  55.45 
 
 
304 aa  352  4e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  54.75 
 
 
304 aa  343  2e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  52.68 
 
 
304 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  52.01 
 
 
317 aa  338  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  52.68 
 
 
304 aa  338  7e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  53.97 
 
 
304 aa  338  9e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  52.35 
 
 
304 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  54.3 
 
 
304 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  52.51 
 
 
308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  53.31 
 
 
304 aa  335  5.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  52.15 
 
 
319 aa  333  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  52.84 
 
 
307 aa  332  4e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  52.17 
 
 
304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  50.66 
 
 
304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  49.84 
 
 
308 aa  324  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  51.17 
 
 
304 aa  323  3e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 
306 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  47.62 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  48.69 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  51.49 
 
 
319 aa  319  3.9999999999999996e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
309 aa  317  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 
309 aa  315  8e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  49.15 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
307 aa  312  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  47.51 
 
 
302 aa  310  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  47.49 
 
 
312 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  47.51 
 
 
303 aa  306  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  47.71 
 
 
308 aa  306  3e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  45.78 
 
 
312 aa  305  8.000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  46.41 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  46.41 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  46.41 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  45.95 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  46.08 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  48.15 
 
 
304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>