More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0464 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
306 aa  639    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  77.45 
 
 
306 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  76.07 
 
 
308 aa  502  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  76.72 
 
 
309 aa  498  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  75.82 
 
 
306 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  74.84 
 
 
306 aa  488  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  71.57 
 
 
311 aa  480  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  72.22 
 
 
307 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  72.22 
 
 
307 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  71.24 
 
 
307 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  71.9 
 
 
307 aa  473  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  71.57 
 
 
307 aa  471  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  72.04 
 
 
309 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  72.22 
 
 
306 aa  464  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  70.26 
 
 
307 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  69.28 
 
 
307 aa  454  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  69.28 
 
 
307 aa  454  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  68.95 
 
 
306 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  68.95 
 
 
306 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  66.01 
 
 
312 aa  434  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  66.01 
 
 
312 aa  434  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  65.8 
 
 
307 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  65.8 
 
 
307 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  65.8 
 
 
307 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  66.34 
 
 
305 aa  431  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  65.8 
 
 
307 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  65.8 
 
 
307 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  65.8 
 
 
307 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  65.8 
 
 
307 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  65.8 
 
 
307 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  66.34 
 
 
309 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  64.82 
 
 
307 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  65.36 
 
 
312 aa  428  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  64.82 
 
 
307 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  64.5 
 
 
307 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  64.5 
 
 
307 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  63.84 
 
 
307 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  63.84 
 
 
307 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  63.52 
 
 
307 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  65.36 
 
 
312 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  64.5 
 
 
307 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  64.5 
 
 
307 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  63.93 
 
 
307 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  64.05 
 
 
306 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  64.17 
 
 
307 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  64.17 
 
 
313 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  60.13 
 
 
307 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  60.46 
 
 
307 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  64.63 
 
 
317 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  65.16 
 
 
316 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  63.4 
 
 
306 aa  411  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  63.07 
 
 
312 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  61.84 
 
 
305 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  63.19 
 
 
313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  61.64 
 
 
310 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  63.05 
 
 
296 aa  394  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  58.77 
 
 
309 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  57.47 
 
 
309 aa  378  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  57.47 
 
 
309 aa  377  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  56.77 
 
 
304 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  56.62 
 
 
307 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  57.62 
 
 
307 aa  360  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  55.3 
 
 
307 aa  359  4e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  55.96 
 
 
307 aa  351  8e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  51.14 
 
 
308 aa  342  5e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  53.42 
 
 
304 aa  340  1e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  55.59 
 
 
306 aa  339  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  53.09 
 
 
304 aa  338  9e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  53.69 
 
 
304 aa  335  7.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  52.3 
 
 
306 aa  334  1e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  52.61 
 
 
304 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  52.65 
 
 
307 aa  331  8e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  51.51 
 
 
304 aa  329  3e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  51.68 
 
 
304 aa  329  4e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  53.2 
 
 
317 aa  328  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  51.51 
 
 
304 aa  328  7e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  51.96 
 
 
304 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  51.01 
 
 
307 aa  328  8e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  51.96 
 
 
304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  51.49 
 
 
304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  53.04 
 
 
308 aa  322  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  53.02 
 
 
309 aa  321  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 
308 aa  317  2e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  49.34 
 
 
319 aa  311  7.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  48.21 
 
 
311 aa  310  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  50.51 
 
 
306 aa  309  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  49.32 
 
 
308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 
302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
307 aa  302  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 
303 aa  301  9e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  48.34 
 
 
319 aa  298  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 
309 aa  297  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 
304 aa  296  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  47.35 
 
 
308 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  47.35 
 
 
308 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 
312 aa  296  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  47.35 
 
 
308 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  47.35 
 
 
308 aa  295  6e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  47.67 
 
 
312 aa  295  8e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  48 
 
 
312 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>