More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1962 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 308 aa  634    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  95.44 
 
 		 309 aa  608  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  74.59 
 
 		 307 aa  480  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  67.33 
 
 		 306 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  63.07 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  64.12 
 
 		 308 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  64.12 
 
 		 308 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  64.12 
 
 		 308 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  63.04 
 
 		 308 aa  407  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  63.37 
 
 		 308 aa  408  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  62.05 
 
 		 308 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  60.9 
 
 		 319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  62.17 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  62.17 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  62.17 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  62.09 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  62.17 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  62.17 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  62.09 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  62.17 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  62.09 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  61.51 
 
 		 309 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  62.17 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  62.17 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  62.09 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  62.17 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  62.09 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  61.72 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  63.51 
 
 		 312 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  59.74 
 
 		 308 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  60.06 
 
 		 312 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  60.2 
 
 		 307 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  60.53 
 
 		 307 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  59.21 
 
 		 312 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  59.54 
 
 		 307 aa  388  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  58.88 
 
 		 312 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0347  branched-chain amino acid aminotransferase  59.54 
 
 		 309 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  57.61 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  54.97 
 
 		 303 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  56.29 
 
 		 303 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  55.3 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  57.19 
 
 		 303 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  55.3 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  55.3 
 
 		 303 aa  362  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  55.63 
 
 		 303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2593  branched-chain amino acid aminotransferase  55.59 
 
 		 320 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0893  branched-chain amino acid aminotransferase  55.59 
 
 		 320 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2457  branched-chain amino acid aminotransferase  55.59 
 
 		 320 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0567  branched-chain amino acid aminotransferase  55.3 
 
 		 314 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  50.99 
 
 		 312 aa  328  8e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  50.16 
 
 		 312 aa  325  6e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  49.84 
 
 		 312 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  52.7 
 
 		 307 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  52.7 
 
 		 307 aa  322  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 307 aa  322  4e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  53.04 
 
 		 306 aa  322  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  53.04 
 
 		 306 aa  321  7e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  52 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  52.03 
 
 		 306 aa  319  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 		 307 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  53.38 
 
 		 307 aa  318  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  53.38 
 
 		 307 aa  318  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  50.82 
 
 		 313 aa  318  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 		 307 aa  318  7e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  51.62 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 312 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  51.64 
 
 		 306 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  50.66 
 
 		 307 aa  317  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  52.03 
 
 		 307 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  50.51 
 
 		 296 aa  316  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  50.65 
 
 		 313 aa  315  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  48.84 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  50.99 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 		 308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 		 307 aa  312  4.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 311 aa  311  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  51.67 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  52.36 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  50.84 
 
 		 319 aa  310  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  50.34 
 
 		 312 aa  309  4e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 306 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  52.63 
 
 		 308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  51.85 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  50.51 
 
 		 304 aa  305  7e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  49.35 
 
 		 307 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  48.65 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  47.68 
 
 		 317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 		 304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  47.81 
 
 		 307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 		 304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  51.01 
 
 		 302 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  49.02 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  49.02 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  49.02 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  49.02 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  49.02 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  49.02 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  49.02 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>