More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4163 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 307 aa  636    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  90.88 
 
 		 307 aa  584  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0347  branched-chain amino acid aminotransferase  86.64 
 
 		 309 aa  566  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  86.64 
 
 		 307 aa  558  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  67.55 
 
 		 308 aa  447  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  67.22 
 
 		 308 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  65.89 
 
 		 308 aa  441  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  68.2 
 
 		 308 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  66.89 
 
 		 308 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  65.57 
 
 		 309 aa  434  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  65.57 
 
 		 309 aa  434  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  65.23 
 
 		 308 aa  435  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  65.57 
 
 		 309 aa  434  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  65.57 
 
 		 309 aa  434  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  65.57 
 
 		 309 aa  434  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  65.57 
 
 		 309 aa  434  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  65.23 
 
 		 308 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  65.23 
 
 		 308 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  65.57 
 
 		 309 aa  434  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  65.25 
 
 		 309 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  65.25 
 
 		 309 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  64.92 
 
 		 309 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  65.25 
 
 		 309 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  64.9 
 
 		 308 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  64.92 
 
 		 309 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  64.92 
 
 		 309 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  64.92 
 
 		 309 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  64.59 
 
 		 319 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  64.59 
 
 		 309 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  62.95 
 
 		 312 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  62.62 
 
 		 312 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  62.87 
 
 		 307 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  60.53 
 
 		 308 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  60.53 
 
 		 309 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  60.33 
 
 		 318 aa  386  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  57.7 
 
 		 306 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  55.07 
 
 		 312 aa  341  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  51.97 
 
 		 303 aa  333  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  51.51 
 
 		 303 aa  325  5e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.98 
 
 		 312 aa  325  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 		 303 aa  323  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  51.16 
 
 		 303 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  52.49 
 
 		 303 aa  321  8e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  50.83 
 
 		 303 aa  315  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 		 303 aa  316  4e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 		 304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0567  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 		 314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  47.97 
 
 		 312 aa  305  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2457  branched-chain amino acid aminotransferase  48.69 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0893  branched-chain amino acid aminotransferase  48.69 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2593  branched-chain amino acid aminotransferase  48.69 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  46.96 
 
 		 307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  47.46 
 
 		 296 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  48 
 
 		 309 aa  299  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  48.64 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  47.14 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  47.49 
 
 		 312 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  46.28 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  46.28 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  46.67 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  48.84 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  48.51 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  45.61 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  47.3 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  48.32 
 
 		 312 aa  289  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  47.68 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  46.38 
 
 		 311 aa  288  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  48.65 
 
 		 306 aa  288  8e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  47.85 
 
 		 307 aa  288  8e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  46 
 
 		 316 aa  287  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  47.81 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  46.56 
 
 		 306 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  47.46 
 
 		 307 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  48.51 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  47.12 
 
 		 307 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  46.13 
 
 		 313 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  46.69 
 
 		 306 aa  285  7e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  45.54 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  45.03 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  46.96 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  43.61 
 
 		 306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.31 
 
 		 305 aa  282  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  46.84 
 
 		 306 aa  281  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  45.36 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  45.27 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  45.79 
 
 		 307 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  46.18 
 
 		 317 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  45.12 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  47.33 
 
 		 309 aa  278  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  46.44 
 
 		 307 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  47.18 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  46.51 
 
 		 306 aa  275  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  45.21 
 
 		 307 aa  275  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  45.21 
 
 		 307 aa  275  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  44.08 
 
 		 311 aa  275  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  44.78 
 
 		 307 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  44.44 
 
 		 307 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  45.97 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  46.51 
 
 		 304 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>