More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1550 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
309 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  95.44 
 
 
308 aa  608  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  75.25 
 
 
307 aa  484  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  67.66 
 
 
306 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  64.47 
 
 
308 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  64.47 
 
 
308 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  64.47 
 
 
308 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  63.49 
 
 
308 aa  411  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  61.89 
 
 
309 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  62.21 
 
 
309 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  62.21 
 
 
309 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  62.5 
 
 
308 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  63.58 
 
 
308 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  62.54 
 
 
309 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  62.54 
 
 
309 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  62.21 
 
 
309 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  62.54 
 
 
309 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  62.54 
 
 
309 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  61.89 
 
 
309 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  62.21 
 
 
309 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  62.21 
 
 
309 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  62.21 
 
 
309 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  62.21 
 
 
309 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  63.16 
 
 
308 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  62.54 
 
 
309 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  62.83 
 
 
319 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  61.56 
 
 
309 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  61.84 
 
 
308 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  64.19 
 
 
312 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  59.87 
 
 
308 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  60.46 
 
 
312 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  59.87 
 
 
312 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  59.54 
 
 
312 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  59.87 
 
 
307 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  60.53 
 
 
307 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  59.54 
 
 
307 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0347  branched-chain amino acid aminotransferase  58.22 
 
 
309 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  57.28 
 
 
303 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  56.62 
 
 
303 aa  375  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  58.31 
 
 
318 aa  374  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  55.96 
 
 
303 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  58.19 
 
 
303 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  56.62 
 
 
303 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  55.63 
 
 
303 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  55.26 
 
 
303 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2593  branched-chain amino acid aminotransferase  55.26 
 
 
320 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0893  branched-chain amino acid aminotransferase  55.26 
 
 
320 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2457  branched-chain amino acid aminotransferase  55.26 
 
 
320 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0567  branched-chain amino acid aminotransferase  54.79 
 
 
314 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 
312 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  52.46 
 
 
311 aa  324  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  52.29 
 
 
306 aa  322  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 
307 aa  322  7e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  49.02 
 
 
312 aa  321  9.000000000000001e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  53.02 
 
 
306 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  51.96 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  48.69 
 
 
312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
308 aa  319  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  52.01 
 
 
307 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  52.01 
 
 
307 aa  319  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 
312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 
307 aa  318  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  49.84 
 
 
313 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  50.66 
 
 
307 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 
307 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 
306 aa  315  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 
296 aa  315  5e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  52.17 
 
 
319 aa  315  5e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  51.69 
 
 
306 aa  315  7e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  51.68 
 
 
307 aa  315  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  48.37 
 
 
312 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  49.84 
 
 
313 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  52.51 
 
 
307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 
307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  52.51 
 
 
307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  52.35 
 
 
307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  51.68 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  51.17 
 
 
312 aa  312  4.999999999999999e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 
311 aa  312  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  50.84 
 
 
307 aa  311  6.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  51.18 
 
 
304 aa  308  6.999999999999999e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  48.51 
 
 
317 aa  308  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  52.33 
 
 
302 aa  308  8e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  52.51 
 
 
306 aa  308  8e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  52.94 
 
 
308 aa  308  9e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  51.84 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 
306 aa  306  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  49.19 
 
 
307 aa  305  6e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  49.34 
 
 
307 aa  305  6e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  49.19 
 
 
307 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  49.19 
 
 
307 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  49.19 
 
 
307 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  49.19 
 
 
307 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  49.19 
 
 
307 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  49.19 
 
 
307 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  49.19 
 
 
307 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  47.21 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.34 
 
 
305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  47.47 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  50.34 
 
 
310 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>