More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0578 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 307 aa  634    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  88.93 
 
 		 307 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  88.93 
 
 		 307 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  85.67 
 
 		 307 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  75.57 
 
 		 307 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  73.11 
 
 		 308 aa  480  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  71.8 
 
 		 309 aa  476  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  72.22 
 
 		 306 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  69.93 
 
 		 306 aa  471  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  71.24 
 
 		 306 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  71.62 
 
 		 309 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  67.32 
 
 		 306 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  69.54 
 
 		 306 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  68.63 
 
 		 307 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  67.97 
 
 		 306 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  67.97 
 
 		 306 aa  444  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 		 307 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 		 307 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 		 307 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 		 307 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 		 307 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 		 307 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 		 307 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 		 307 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 		 307 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 		 307 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 		 307 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  66.12 
 
 		 307 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  66.12 
 
 		 307 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  64.9 
 
 		 307 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  65.15 
 
 		 307 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  66.12 
 
 		 307 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  67.12 
 
 		 311 aa  431  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  66.12 
 
 		 307 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  64.9 
 
 		 307 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  64.82 
 
 		 307 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  65.69 
 
 		 305 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  65.15 
 
 		 307 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  65.36 
 
 		 312 aa  427  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  64.71 
 
 		 309 aa  424  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  65.03 
 
 		 306 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  63.73 
 
 		 312 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  64.69 
 
 		 307 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  63.25 
 
 		 312 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  62.75 
 
 		 312 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  60.91 
 
 		 307 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  61.24 
 
 		 307 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  61.89 
 
 		 313 aa  411  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  62.7 
 
 		 317 aa  407  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  63.91 
 
 		 306 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  61.44 
 
 		 312 aa  404  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  62.62 
 
 		 310 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  61.29 
 
 		 316 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  59.61 
 
 		 313 aa  394  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  62.89 
 
 		 296 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  59.21 
 
 		 305 aa  388  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  57.76 
 
 		 304 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  54.87 
 
 		 309 aa  360  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  53.57 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  53.9 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  55.15 
 
 		 307 aa  351  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  54.15 
 
 		 307 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  56.8 
 
 		 307 aa  349  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  54.15 
 
 		 307 aa  345  6e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  53.82 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  55.22 
 
 		 317 aa  335  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  51.95 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  52.51 
 
 		 307 aa  328  6e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  54.08 
 
 		 306 aa  326  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  52.29 
 
 		 304 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  52.29 
 
 		 304 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  52.29 
 
 		 304 aa  322  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  51.66 
 
 		 304 aa  322  7e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  52.35 
 
 		 304 aa  318  5e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  52.35 
 
 		 304 aa  318  9e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  52.01 
 
 		 304 aa  317  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  52.03 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 		 319 aa  316  3e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  52.72 
 
 		 307 aa  315  5e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  51.68 
 
 		 309 aa  315  9e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 		 308 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  50.99 
 
 		 308 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  50.66 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 		 304 aa  308  8e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  51.84 
 
 		 304 aa  308  9e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  50.84 
 
 		 312 aa  308  9e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  50.84 
 
 		 308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 		 312 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 		 306 aa  305  6e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 		 308 aa  305  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  50.83 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 312 aa  299  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  47.16 
 
 		 311 aa  298  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  47.9 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  51.7 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.204453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>