More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0549 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 303 aa  623  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  83.83 
 
 		 303 aa  534  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  82.84 
 
 		 303 aa  531  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  82.18 
 
 		 303 aa  531  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  81.85 
 
 		 303 aa  526  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  82.18 
 
 		 303 aa  524  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  80.86 
 
 		 303 aa  514  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  63.3 
 
 		 312 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  57.28 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  56.91 
 
 		 307 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  56.77 
 
 		 306 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  56.29 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  57.19 
 
 		 312 aa  363  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  53.31 
 
 		 319 aa  339  2.9999999999999998e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  52.49 
 
 		 308 aa  339  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  52.82 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  53.16 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  52.16 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  52.16 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  52.16 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  52 
 
 		 308 aa  331  7.000000000000001e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  52.65 
 
 		 318 aa  331  9e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  52.16 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  52.16 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  52.16 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  53.64 
 
 		 312 aa  331  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  52.16 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  52.16 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  52.16 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  52.16 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  51.83 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  53.31 
 
 		 312 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  51.83 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  51.83 
 
 		 308 aa  328  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  51.5 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  51.5 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  51.5 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  51.5 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  51.5 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  51.5 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  51.33 
 
 		 308 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  51.5 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  50.99 
 
 		 307 aa  319  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  48.5 
 
 		 312 aa  318  6e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  50.83 
 
 		 307 aa  315  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  48.51 
 
 		 312 aa  315  8e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  48.18 
 
 		 312 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 302 aa  308  5e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  48.33 
 
 		 312 aa  308  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  48.17 
 
 		 309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0893  branched-chain amino acid aminotransferase  50.99 
 
 		 320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2457  branched-chain amino acid aminotransferase  50.99 
 
 		 320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2593  branched-chain amino acid aminotransferase  50.99 
 
 		 320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  47.84 
 
 		 312 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0567  branched-chain amino acid aminotransferase  50.99 
 
 		 314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  47.51 
 
 		 312 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0347  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  48.66 
 
 		 307 aa  304  9.000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 		 307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  48.5 
 
 		 304 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  47.35 
 
 		 313 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 		 307 aa  298  7e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  46.31 
 
 		 308 aa  298  9e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  46.73 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  48.01 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  47.85 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  48.51 
 
 		 307 aa  296  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  48.36 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  46.38 
 
 		 313 aa  295  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  47.64 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  46.86 
 
 		 319 aa  290  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  47.7 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.01 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  47.85 
 
 		 319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 		 307 aa  288  6e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  45.97 
 
 		 306 aa  287  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  46.64 
 
 		 306 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  47.37 
 
 		 307 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  45.97 
 
 		 306 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  47.68 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  47.68 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  46.36 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  47.68 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  46.62 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  48.03 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  48.03 
 
 		 307 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  48.03 
 
 		 307 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  48.03 
 
 		 307 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  48.03 
 
 		 307 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  48.03 
 
 		 307 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  48.03 
 
 		 307 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  48.03 
 
 		 307 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  44.92 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  45.97 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0192  branched-chain amino acid aminotransferase  46.71 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.749275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  45.97 
 
 		 307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  46.71 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>