More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0192 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0192  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
304 aa  633  1e-180  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.749275 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  47.49 
 
 
312 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  48.33 
 
 
311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  48.33 
 
 
307 aa  299  5e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  46.67 
 
 
307 aa  295  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  44.33 
 
 
312 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  44 
 
 
312 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  44 
 
 
312 aa  292  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  45.67 
 
 
307 aa  291  8e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  43.67 
 
 
312 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  45.36 
 
 
308 aa  289  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  45.07 
 
 
309 aa  288  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  43.33 
 
 
312 aa  288  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  44.52 
 
 
313 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  48.51 
 
 
319 aa  285  5.999999999999999e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  43.93 
 
 
317 aa  285  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  44.41 
 
 
302 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  46.71 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.33 
 
 
305 aa  282  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  47.18 
 
 
319 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  44.22 
 
 
312 aa  280  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  44.08 
 
 
303 aa  279  5e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  45.39 
 
 
307 aa  278  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  45.67 
 
 
306 aa  275  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  45.07 
 
 
303 aa  275  7e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  44.41 
 
 
303 aa  275  7e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  43.52 
 
 
309 aa  275  9e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  45.54 
 
 
304 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  43.85 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  43.09 
 
 
303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  45.54 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  45.57 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.3 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  45.25 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  43.19 
 
 
309 aa  273  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  45.54 
 
 
304 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  45.3 
 
 
308 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
303 aa  272  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  42.57 
 
 
306 aa  272  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  44.12 
 
 
307 aa  272  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  44.95 
 
 
308 aa  271  7e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  43.33 
 
 
307 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  43.05 
 
 
307 aa  271  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  42.57 
 
 
296 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  45.33 
 
 
309 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  43.85 
 
 
304 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 
313 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  43.09 
 
 
302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  44.88 
 
 
317 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  43.33 
 
 
306 aa  269  5e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  44.33 
 
 
306 aa  268  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  43.67 
 
 
306 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  43.28 
 
 
304 aa  267  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  41.78 
 
 
316 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  43.38 
 
 
307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  44 
 
 
307 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  44 
 
 
307 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  42.57 
 
 
309 aa  266  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  44.26 
 
 
304 aa  265  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  43.33 
 
 
310 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  43.33 
 
 
306 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  44.67 
 
 
307 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  43.93 
 
 
304 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  43.56 
 
 
304 aa  264  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  43.71 
 
 
307 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  44.26 
 
 
307 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  44.15 
 
 
312 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  42 
 
 
306 aa  263  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  43.71 
 
 
307 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  42.57 
 
 
339 aa  262  4.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  44.52 
 
 
312 aa  262  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  43.67 
 
 
305 aa  261  6.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0347  branched-chain amino acid aminotransferase  44.26 
 
 
309 aa  261  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  42.33 
 
 
309 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.13 
 
 
308 aa  261  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  44.08 
 
 
318 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  43.61 
 
 
304 aa  260  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  43.71 
 
 
308 aa  259  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  44.82 
 
 
304 aa  260  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  42.33 
 
 
306 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  41.78 
 
 
306 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  42.76 
 
 
308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  42.43 
 
 
308 aa  258  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  43.05 
 
 
307 aa  258  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  42.19 
 
 
308 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 
307 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 
307 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 
307 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  43.48 
 
 
319 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  43.81 
 
 
307 aa  257  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 
307 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  44.26 
 
 
307 aa  257  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  42.23 
 
 
307 aa  256  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  43.24 
 
 
307 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 
307 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  42.19 
 
 
307 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  42.19 
 
 
307 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  43.29 
 
 
307 aa  255  6e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  43.92 
 
 
307 aa  254  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.976398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>