More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1404 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
304 aa  627  1e-179  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  85.53 
 
 
304 aa  554  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  85.86 
 
 
304 aa  556  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  85.53 
 
 
304 aa  553  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  73.49 
 
 
304 aa  474  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  72.82 
 
 
304 aa  471  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  71.05 
 
 
304 aa  463  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  64.59 
 
 
306 aa  422  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  65.45 
 
 
307 aa  424  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  63.46 
 
 
308 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  59.08 
 
 
307 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  58.75 
 
 
307 aa  358  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  58.75 
 
 
307 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  58.75 
 
 
307 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  58.09 
 
 
307 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  58.75 
 
 
307 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  58.09 
 
 
307 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  58.09 
 
 
307 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  58.09 
 
 
307 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  58.42 
 
 
307 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  58.42 
 
 
307 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  58.42 
 
 
307 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  58.42 
 
 
307 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  58.42 
 
 
307 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  58.42 
 
 
307 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  58.42 
 
 
307 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  58.42 
 
 
307 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  57.76 
 
 
307 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  55.41 
 
 
312 aa  352  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  56.62 
 
 
306 aa  348  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  55.74 
 
 
312 aa  348  9e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  56.04 
 
 
306 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  54.75 
 
 
312 aa  343  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  55.96 
 
 
309 aa  340  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  54.36 
 
 
307 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  54.1 
 
 
312 aa  340  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  51.99 
 
 
306 aa  337  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  54.75 
 
 
307 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  53.02 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  53.02 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  54.36 
 
 
307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 
306 aa  333  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  53.11 
 
 
312 aa  332  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  53.69 
 
 
306 aa  332  7.000000000000001e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  54.3 
 
 
306 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  51.99 
 
 
306 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  53.23 
 
 
317 aa  329  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  51.68 
 
 
306 aa  329  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  53.27 
 
 
313 aa  329  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  52.33 
 
 
307 aa  328  7e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  51.34 
 
 
308 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  52.98 
 
 
310 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 
307 aa  323  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  51.79 
 
 
316 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  50.83 
 
 
309 aa  322  4e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 
307 aa  322  5e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  51.66 
 
 
307 aa  322  7e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  51.57 
 
 
311 aa  321  8e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  50.66 
 
 
307 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  52.17 
 
 
296 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 
307 aa  318  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  52.67 
 
 
307 aa  318  5e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 
307 aa  318  6e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  49.66 
 
 
309 aa  318  7e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  50.66 
 
 
313 aa  318  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  49.66 
 
 
306 aa  316  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  52.49 
 
 
309 aa  316  4e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  51.67 
 
 
307 aa  315  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.17 
 
 
305 aa  315  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  49.34 
 
 
306 aa  315  7e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  50.99 
 
 
305 aa  315  8e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  52.49 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  52.01 
 
 
307 aa  311  6.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 
304 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  50.66 
 
 
304 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 
304 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  51.83 
 
 
307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  48.68 
 
 
319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  48.84 
 
 
309 aa  296  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  47.32 
 
 
311 aa  296  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  48.67 
 
 
312 aa  293  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  48.65 
 
 
304 aa  292  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.16 
 
 
312 aa  288  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  46.71 
 
 
319 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  45 
 
 
308 aa  286  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  45.03 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  46.51 
 
 
307 aa  281  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  47.67 
 
 
309 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  46.33 
 
 
309 aa  277  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  46.23 
 
 
303 aa  276  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  45.57 
 
 
303 aa  276  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  45.9 
 
 
303 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  47.18 
 
 
302 aa  275  6e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  45.57 
 
 
303 aa  275  6e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  44.85 
 
 
308 aa  275  6e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  45.97 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.94 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  46.23 
 
 
303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  46.36 
 
 
312 aa  273  3e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>