More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0379 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
307 aa  632  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  52.61 
 
 
308 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  53.09 
 
 
312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  51.48 
 
 
308 aa  308  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  51.8 
 
 
308 aa  308  9e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  51.15 
 
 
308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  47.68 
 
 
311 aa  305  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  50.49 
 
 
308 aa  305  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  50.82 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  50.82 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  50.82 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  49.84 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  51.48 
 
 
308 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  49.51 
 
 
309 aa  299  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  49.51 
 
 
309 aa  299  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  49.51 
 
 
309 aa  299  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  49.51 
 
 
309 aa  299  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  49.51 
 
 
309 aa  299  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  50.49 
 
 
309 aa  299  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  49.51 
 
 
309 aa  299  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  49.51 
 
 
309 aa  299  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  49.51 
 
 
309 aa  299  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  49.51 
 
 
309 aa  299  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  50.16 
 
 
309 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  48.67 
 
 
319 aa  297  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  48.03 
 
 
308 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  50.16 
 
 
309 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  50.16 
 
 
309 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  50.16 
 
 
309 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  46.84 
 
 
312 aa  297  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  49.34 
 
 
306 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  47.39 
 
 
309 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  49.84 
 
 
309 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  47.87 
 
 
309 aa  295  6e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 
307 aa  295  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 
307 aa  295  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  46.86 
 
 
307 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  48.18 
 
 
302 aa  293  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  47.18 
 
 
306 aa  293  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  46.23 
 
 
307 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  47.51 
 
 
306 aa  292  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  45.48 
 
 
308 aa  290  2e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  51.01 
 
 
312 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  47.33 
 
 
312 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  47.33 
 
 
312 aa  289  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  47.19 
 
 
304 aa  288  6e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  47.85 
 
 
304 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  48.01 
 
 
302 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 
304 aa  287  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  47.35 
 
 
307 aa  286  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  47.7 
 
 
307 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  46.18 
 
 
307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  45.75 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  46.86 
 
 
307 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  46.53 
 
 
304 aa  285  8e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  47.37 
 
 
304 aa  285  8e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  46.25 
 
 
339 aa  285  8e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  46.53 
 
 
304 aa  285  8e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  47.04 
 
 
306 aa  285  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  48.05 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  47.02 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  44.85 
 
 
307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  44.88 
 
 
307 aa  281  9e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  45.6 
 
 
304 aa  281  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  46.51 
 
 
304 aa  281  1e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  45.85 
 
 
307 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  43.96 
 
 
312 aa  279  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  44.95 
 
 
307 aa  278  7e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  46.41 
 
 
303 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  44.41 
 
 
306 aa  276  4e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  47.84 
 
 
309 aa  275  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  45.25 
 
 
304 aa  275  6e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  47.49 
 
 
306 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  45.6 
 
 
308 aa  275  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  46.67 
 
 
305 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  46.33 
 
 
307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  45.67 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  46.41 
 
 
303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  47.02 
 
 
303 aa  273  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  46.67 
 
 
307 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  47.33 
 
 
303 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  47.33 
 
 
303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0192  branched-chain amino acid aminotransferase  44.12 
 
 
304 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.749275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  42.86 
 
 
312 aa  272  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  45.54 
 
 
307 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  46.84 
 
 
307 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  45.64 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  42 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  46.51 
 
 
307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  46.51 
 
 
307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  46 
 
 
303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  43 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  46.84 
 
 
307 aa  269  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  44.34 
 
 
307 aa  269  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  46 
 
 
307 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  46.51 
 
 
307 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  45.51 
 
 
310 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  45.28 
 
 
306 aa  268  8e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
316 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  41.33 
 
 
312 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>