More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1877 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 306 aa  635    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  64.26 
 
 		 304 aa  425  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  63.93 
 
 		 304 aa  423  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  64.59 
 
 		 304 aa  422  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  63.28 
 
 		 304 aa  421  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  63.61 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  62.95 
 
 		 304 aa  408  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  61.31 
 
 		 308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  63.21 
 
 		 304 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  59.27 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  54.28 
 
 		 306 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  52.3 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  51.33 
 
 		 312 aa  331  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  52.63 
 
 		 306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  50.67 
 
 		 312 aa  323  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  53.33 
 
 		 307 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  51 
 
 		 312 aa  322  7e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  53 
 
 		 307 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  53 
 
 		 307 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  53 
 
 		 307 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  53 
 
 		 307 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 		 312 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  52.33 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  51 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  52.33 
 
 		 307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 		 312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  51.17 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  51.17 
 
 		 306 aa  318  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  52.67 
 
 		 307 aa  318  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  52.33 
 
 		 307 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  50.83 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  52.33 
 
 		 307 aa  316  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  49.01 
 
 		 307 aa  316  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  48.68 
 
 		 307 aa  316  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 		 306 aa  316  3e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  48 
 
 		 307 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  48 
 
 		 307 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  49.51 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  52 
 
 		 307 aa  310  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  52 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  52 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  52 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  52 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  52 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  49.84 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  52 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  48.2 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  52 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  50.84 
 
 		 306 aa  309  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 316 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.5 
 
 		 305 aa  308  9e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  49.34 
 
 		 306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  48.66 
 
 		 296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  50.66 
 
 		 307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 		 307 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 		 307 aa  305  9.000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  48.49 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  48.67 
 
 		 307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  48.16 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  47.84 
 
 		 313 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  47.83 
 
 		 307 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  47.83 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  48.2 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  48.85 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  47.81 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  45.82 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  47.33 
 
 		 307 aa  292  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  47.35 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  48.68 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  47.87 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  47.54 
 
 		 304 aa  289  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  46.86 
 
 		 308 aa  289  4e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  46.36 
 
 		 309 aa  287  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  47.33 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  47.67 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  47.52 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  46.03 
 
 		 304 aa  282  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  46.71 
 
 		 319 aa  279  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  44.41 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  47.21 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  45.18 
 
 		 302 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  45.51 
 
 		 309 aa  272  6e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  45.67 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  44.85 
 
 		 304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  44.12 
 
 		 303 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  45.18 
 
 		 309 aa  267  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  47.18 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  45.1 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  44.22 
 
 		 309 aa  267  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  42.48 
 
 		 303 aa  267  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  43.46 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  42.67 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  43.46 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  43.46 
 
 		 303 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.720294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>