More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4078 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 304 aa  619  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  60.93 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  59.8 
 
 		 306 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  61.39 
 
 		 307 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  61.72 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  60.93 
 
 		 306 aa  381  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  61.39 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  61.39 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  61.39 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  61.39 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  61.39 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  61.39 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  61.39 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  60.07 
 
 		 307 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  62.25 
 
 		 306 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  60.07 
 
 		 307 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  57.62 
 
 		 305 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  58.09 
 
 		 306 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  58.75 
 
 		 306 aa  374  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  58.55 
 
 		 309 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  57.76 
 
 		 307 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  59.74 
 
 		 307 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  59.74 
 
 		 307 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  60.07 
 
 		 307 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  59.41 
 
 		 307 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  56.11 
 
 		 307 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  60.07 
 
 		 307 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  60.07 
 
 		 307 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  57.95 
 
 		 305 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  59.41 
 
 		 307 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  60.8 
 
 		 306 aa  371  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  55.78 
 
 		 307 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  60.07 
 
 		 307 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  58.17 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  57.28 
 
 		 307 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  57.28 
 
 		 311 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  56.77 
 
 		 306 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  56.62 
 
 		 307 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  54.97 
 
 		 307 aa  359  3e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  56.62 
 
 		 308 aa  359  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  55.59 
 
 		 312 aa  359  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  54.97 
 
 		 307 aa  358  6e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  56.81 
 
 		 307 aa  358  8e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  56.81 
 
 		 307 aa  358  8e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  56.11 
 
 		 312 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  56.44 
 
 		 307 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  56.11 
 
 		 312 aa  355  5e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  56.62 
 
 		 310 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  55.45 
 
 		 312 aa  352  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  56.58 
 
 		 313 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  54.64 
 
 		 312 aa  348  5e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  54.49 
 
 		 306 aa  348  8e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  54.28 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  54.61 
 
 		 296 aa  340  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  53.9 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  53.75 
 
 		 316 aa  339  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  54.67 
 
 		 309 aa  338  8e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  53.77 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  52.79 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  52.46 
 
 		 309 aa  329  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  55.22 
 
 		 304 aa  319  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 		 307 aa  318  7e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  52.2 
 
 		 307 aa  317  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  54.55 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  54.55 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  50.33 
 
 		 307 aa  316  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  52.86 
 
 		 317 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  50.68 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  51.53 
 
 		 307 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  48.48 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  53.72 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  50.51 
 
 		 307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  47.3 
 
 		 307 aa  298  9e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  48.51 
 
 		 308 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 		 309 aa  295  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 		 309 aa  295  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 		 309 aa  295  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 		 309 aa  295  7e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 		 309 aa  295  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 		 309 aa  295  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 		 309 aa  295  7e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 		 309 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  49.16 
 
 		 309 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  48.48 
 
 		 304 aa  295  9e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  49.33 
 
 		 319 aa  294  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  49.16 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  48.65 
 
 		 304 aa  292  6e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  48.82 
 
 		 309 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  47.51 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  47.85 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  47.85 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  47.85 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 		 309 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  47.19 
 
 		 308 aa  289  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  49 
 
 		 319 aa  288  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>