More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0506 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 316 aa  655    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  85.76 
 
 		 312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  82.59 
 
 		 312 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  82.59 
 
 		 312 aa  557  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  82.28 
 
 		 312 aa  557  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  83.55 
 
 		 307 aa  554  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  81.33 
 
 		 312 aa  548  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  81.39 
 
 		 313 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  82.33 
 
 		 317 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  81.07 
 
 		 313 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  83 
 
 		 296 aa  532  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  70.1 
 
 		 307 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  70.1 
 
 		 307 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  69.77 
 
 		 307 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  70.1 
 
 		 307 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  70.1 
 
 		 307 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  70.1 
 
 		 307 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  70.1 
 
 		 307 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  70.1 
 
 		 307 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  69.13 
 
 		 307 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  69.13 
 
 		 307 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  68.81 
 
 		 307 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  69.13 
 
 		 307 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  69.13 
 
 		 307 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  69.13 
 
 		 307 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  69.13 
 
 		 307 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  69.13 
 
 		 307 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  69.13 
 
 		 307 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  69.13 
 
 		 307 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  66.45 
 
 		 309 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  67.42 
 
 		 306 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  65.81 
 
 		 306 aa  431  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  64.84 
 
 		 306 aa  428  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  65.16 
 
 		 307 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  61.61 
 
 		 310 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  65.16 
 
 		 306 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  63.23 
 
 		 306 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  62.26 
 
 		 308 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  63.55 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  62.34 
 
 		 306 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  62.26 
 
 		 307 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  61.29 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  60 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  60 
 
 		 307 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  61.61 
 
 		 309 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  59.35 
 
 		 307 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  59.49 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  61.29 
 
 		 306 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  60 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  60.19 
 
 		 309 aa  390  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  59.74 
 
 		 311 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  59.68 
 
 		 305 aa  387  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  60 
 
 		 307 aa  388  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  59.87 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  60.52 
 
 		 305 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  58.71 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  58.71 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  60.65 
 
 		 306 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  57.61 
 
 		 307 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  56.31 
 
 		 307 aa  371  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  54.69 
 
 		 307 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  55.67 
 
 		 306 aa  358  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  54.69 
 
 		 307 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  55.95 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  54.07 
 
 		 307 aa  352  7e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  53.75 
 
 		 304 aa  339  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 		 317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  52.98 
 
 		 304 aa  335  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  52.65 
 
 		 304 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  51.79 
 
 		 304 aa  323  2e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  52.3 
 
 		 304 aa  323  3e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  52.3 
 
 		 304 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  50.83 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  51.64 
 
 		 304 aa  320  3e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  51.49 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  50.49 
 
 		 319 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 304 aa  309  4e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 307 aa  306  3e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  50.49 
 
 		 319 aa  302  5.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 		 309 aa  302  6.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  47.33 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  48.18 
 
 		 312 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  47.52 
 
 		 312 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  47.08 
 
 		 308 aa  299  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  46.13 
 
 		 308 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  46.13 
 
 		 308 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  46.13 
 
 		 308 aa  299  5e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  48.84 
 
 		 309 aa  298  6e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  46.31 
 
 		 311 aa  298  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  47.16 
 
 		 306 aa  298  8e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  46.13 
 
 		 309 aa  297  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  45.48 
 
 		 308 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  48.29 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  45.81 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  45.81 
 
 		 308 aa  295  8e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  45.16 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  47.19 
 
 		 319 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>