More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2675 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
288 aa  587  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  59.79 
 
 
297 aa  353  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  60.07 
 
 
299 aa  351  8e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  58.74 
 
 
292 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  57.65 
 
 
292 aa  343  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  54.9 
 
 
293 aa  341  8e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  56.64 
 
 
293 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  56.99 
 
 
299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  54.9 
 
 
291 aa  335  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  56.64 
 
 
298 aa  333  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  56.64 
 
 
298 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  56.64 
 
 
298 aa  333  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  56.99 
 
 
298 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  56.64 
 
 
298 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  54.2 
 
 
299 aa  333  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  56.64 
 
 
298 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  56.99 
 
 
298 aa  333  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  56.64 
 
 
298 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  56.64 
 
 
299 aa  332  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  56.29 
 
 
298 aa  332  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  55.24 
 
 
288 aa  332  5e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  56.64 
 
 
298 aa  330  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  54.2 
 
 
299 aa  329  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  54.2 
 
 
299 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  54.2 
 
 
299 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  54.2 
 
 
299 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  54.2 
 
 
299 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  54.2 
 
 
299 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  54.2 
 
 
299 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  53.85 
 
 
299 aa  328  7e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  54.2 
 
 
299 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  55.24 
 
 
293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  53.85 
 
 
299 aa  326  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  56.1 
 
 
295 aa  325  4.0000000000000003e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  55.24 
 
 
293 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  56.83 
 
 
288 aa  323  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  55.9 
 
 
289 aa  318  6e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  54.67 
 
 
297 aa  309  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  55.23 
 
 
295 aa  309  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  51.74 
 
 
290 aa  301  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  53.96 
 
 
287 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  53.29 
 
 
347 aa  300  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  51.39 
 
 
288 aa  300  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  53.41 
 
 
287 aa  299  3e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  53.15 
 
 
297 aa  298  5e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  52.69 
 
 
287 aa  295  5e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  51.4 
 
 
292 aa  292  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  50.18 
 
 
292 aa  279  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  48.61 
 
 
286 aa  279  4e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 
286 aa  275  5e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
303 aa  273  3e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  47.46 
 
 
282 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  42.75 
 
 
308 aa  207  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  39.15 
 
 
302 aa  205  7e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  39.29 
 
 
311 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  40.85 
 
 
307 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  40.49 
 
 
313 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  41.37 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  37.72 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  38.79 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  39.36 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  39.01 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  38.57 
 
 
307 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.87 
 
 
308 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  40.43 
 
 
307 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  39.02 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  40.28 
 
 
304 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  40.28 
 
 
304 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  39.01 
 
 
312 aa  195  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 
304 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  38.3 
 
 
312 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.5 
 
 
305 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  38.57 
 
 
307 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  39.29 
 
 
305 aa  193  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  38.43 
 
 
304 aa  193  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  40.57 
 
 
312 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  41.28 
 
 
308 aa  192  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  39.51 
 
 
317 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  38.57 
 
 
307 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  38.54 
 
 
307 aa  191  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  39.78 
 
 
296 aa  191  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  40.36 
 
 
309 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  40.57 
 
 
312 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  39.6 
 
 
317 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
303 aa  191  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  36.84 
 
 
306 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  37.37 
 
 
304 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  37.81 
 
 
313 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  39.72 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  40.89 
 
 
303 aa  189  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  40.21 
 
 
306 aa  188  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  39.02 
 
 
309 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
304 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  39.15 
 
 
308 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  36.3 
 
 
319 aa  186  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  38.79 
 
 
308 aa  185  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  38.57 
 
 
307 aa  185  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  39.16 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  39.51 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>