More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0476 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
303 aa  621  1e-177  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  68.66 
 
 
289 aa  413  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  67.13 
 
 
347 aa  404  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  65.49 
 
 
288 aa  403  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  64.44 
 
 
292 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  66.08 
 
 
297 aa  392  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  65.85 
 
 
292 aa  388  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  63.29 
 
 
297 aa  384  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  52.63 
 
 
292 aa  315  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  51.75 
 
 
297 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
292 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
299 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  48.77 
 
 
293 aa  292  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  52.14 
 
 
286 aa  291  7e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  50.72 
 
 
299 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  49.47 
 
 
293 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  50.34 
 
 
287 aa  289  4e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 
287 aa  288  8e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 
287 aa  288  8e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  48.94 
 
 
293 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
299 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
299 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
299 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
299 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  48.57 
 
 
293 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
299 aa  285  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
299 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
299 aa  285  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
299 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  49.65 
 
 
291 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  49.47 
 
 
299 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  49.47 
 
 
299 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  51.43 
 
 
286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  49.47 
 
 
295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  49.12 
 
 
299 aa  281  8.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
298 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
298 aa  279  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
298 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
298 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  48.78 
 
 
298 aa  279  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
298 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
298 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
298 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
298 aa  279  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  48.78 
 
 
298 aa  278  9e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  50.17 
 
 
295 aa  275  8e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
288 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  45.61 
 
 
290 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  46.69 
 
 
288 aa  270  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  46.29 
 
 
288 aa  252  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  42.05 
 
 
282 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  39.04 
 
 
319 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  40.55 
 
 
308 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  40.96 
 
 
311 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  38.16 
 
 
319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  39.8 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  39.38 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  39.15 
 
 
307 aa  195  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  39.15 
 
 
307 aa  195  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  39.15 
 
 
307 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
309 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
309 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
309 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
309 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
309 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
309 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
309 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  39.5 
 
 
307 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
309 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  39.86 
 
 
309 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  40.14 
 
 
307 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  40.27 
 
 
309 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  40.64 
 
 
308 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  39.15 
 
 
307 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  39.15 
 
 
308 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  39.5 
 
 
305 aa  192  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  40.28 
 
 
308 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  38.43 
 
 
306 aa  192  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  39.5 
 
 
309 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  39.5 
 
 
309 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  39.5 
 
 
309 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  39.5 
 
 
309 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  37.59 
 
 
306 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  39.15 
 
 
308 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  39.15 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  35.84 
 
 
304 aa  189  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  35.84 
 
 
309 aa  189  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  38.52 
 
 
306 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  37.37 
 
 
307 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  40.68 
 
 
312 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.98 
 
 
308 aa  188  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  39.15 
 
 
308 aa  188  9e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  38.79 
 
 
309 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  36.65 
 
 
308 aa  187  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  40.14 
 
 
307 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  37.72 
 
 
312 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>