More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1756 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 303 aa  610  1e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  76.24 
 
 		 303 aa  498  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  47.33 
 
 		 305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 		 304 aa  295  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  50.99 
 
 		 304 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  47.51 
 
 		 307 aa  291  8e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  50.66 
 
 		 304 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  43.38 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  48.82 
 
 		 306 aa  290  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  43.05 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  42.72 
 
 		 306 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  48.16 
 
 		 307 aa  285  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  47.65 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  48.16 
 
 		 307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  47.99 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  48.16 
 
 		 307 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  48.16 
 
 		 307 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  48.16 
 
 		 307 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  47.83 
 
 		 307 aa  281  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  44.19 
 
 		 308 aa  280  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  48.18 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  47.83 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  47.47 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  47.14 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  47.83 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  47.16 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  44.19 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  47.16 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  47.16 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  47.16 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  47.16 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  47.16 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  47.16 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  47.16 
 
 		 307 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  48.48 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  48.15 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  48.15 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  48.15 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  43.67 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  45.21 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  46.8 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  45.64 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  45.79 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  46.46 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  45.3 
 
 		 307 aa  272  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  46.13 
 
 		 306 aa  271  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  46.8 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  42.71 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  44.44 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  44.04 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  44.7 
 
 		 311 aa  269  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  44 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  47.47 
 
 		 307 aa  268  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  47.7 
 
 		 319 aa  267  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  43.33 
 
 		 307 aa  267  1e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  46 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  46.8 
 
 		 308 aa  266  5e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  46.51 
 
 		 311 aa  265  5.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  47.14 
 
 		 306 aa  265  7e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  42.62 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  43.85 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  46.03 
 
 		 309 aa  262  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  44.44 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  45.33 
 
 		 307 aa  262  6e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  44.44 
 
 		 307 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  46 
 
 		 307 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 312 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  45.82 
 
 		 306 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  45.64 
 
 		 306 aa  261  8.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  47.04 
 
 		 319 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  43.58 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  45.03 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  45.03 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  45.03 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  45.03 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  42.91 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  44.44 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.33 
 
 		 312 aa  259  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  41.75 
 
 		 312 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  42.76 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  44.7 
 
 		 309 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  45 
 
 		 307 aa  258  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  44.3 
 
 		 306 aa  259  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  45.79 
 
 		 307 aa  259  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  44.67 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  44.67 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  44.67 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  44.67 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  44.67 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  44.67 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  44.67 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  44.67 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  44.67 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  44.12 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  42.67 
 
 		 304 aa  256  4e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  43.19 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  42.95 
 
 		 313 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>