More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3362 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
311 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  59.8 
 
 
308 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  59.15 
 
 
307 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  59.15 
 
 
310 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  55.31 
 
 
322 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  55.63 
 
 
306 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  53.97 
 
 
306 aa  359  3e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  53.31 
 
 
306 aa  358  9e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  53.25 
 
 
322 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  44.75 
 
 
302 aa  298  6e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  51.48 
 
 
318 aa  295  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  42.9 
 
 
305 aa  294  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  43.71 
 
 
303 aa  272  5.000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  44.7 
 
 
303 aa  269  4e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  41.53 
 
 
304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  41.91 
 
 
307 aa  245  6e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 
306 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  42.33 
 
 
306 aa  245  6.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  42.26 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 
307 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  41.25 
 
 
306 aa  238  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1720  branched-chain amino acid aminotransferase  38.26 
 
 
316 aa  235  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 
308 aa  235  8e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  40.2 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  39.29 
 
 
309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  42.76 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  42.37 
 
 
312 aa  231  9e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  39.14 
 
 
308 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  41.53 
 
 
306 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  38.13 
 
 
304 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  41.06 
 
 
302 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 
309 aa  230  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  37.46 
 
 
304 aa  230  3e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  42.21 
 
 
319 aa  229  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  41.75 
 
 
307 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  39.8 
 
 
308 aa  228  8e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  40.2 
 
 
307 aa  228  8e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 
304 aa  228  9e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  40.74 
 
 
304 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  41.12 
 
 
308 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 
311 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  41.23 
 
 
312 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  42.38 
 
 
319 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 
309 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  40.26 
 
 
306 aa  227  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  41.28 
 
 
309 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  40.34 
 
 
304 aa  226  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  40.91 
 
 
312 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0408  branched-chain amino acid aminotransferase  37.91 
 
 
303 aa  226  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 
309 aa  226  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  38.46 
 
 
309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  40.79 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  42.42 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 
311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 
307 aa  225  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  40.46 
 
 
308 aa  225  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 
307 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  38.13 
 
 
309 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 
307 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  37.58 
 
 
304 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0893  branched-chain amino acid aminotransferase  41.83 
 
 
320 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  40.13 
 
 
306 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  39.67 
 
 
304 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 
307 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2593  branched-chain amino acid aminotransferase  41.83 
 
 
320 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2457  branched-chain amino acid aminotransferase  41.83 
 
 
320 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  37.58 
 
 
304 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  39.33 
 
 
304 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  39.2 
 
 
307 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 
307 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  37.79 
 
 
304 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.54 
 
 
305 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  40.78 
 
 
307 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 
307 aa  223  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 
307 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 
307 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  38.13 
 
 
304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  37.17 
 
 
308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  40.51 
 
 
309 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  40.51 
 
 
309 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  39.2 
 
 
307 aa  222  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  40.51 
 
 
309 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  40.51 
 
 
309 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3033  branched-chain amino acid aminotransferase  37.94 
 
 
317 aa  222  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0183291 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  39.2 
 
 
307 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  39.2 
 
 
307 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  39.2 
 
 
307 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  39.2 
 
 
307 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  39.2 
 
 
307 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  37.54 
 
 
312 aa  222  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  39.2 
 
 
307 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  39.2 
 
 
307 aa  222  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.9 
 
 
312 aa  222  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  39.2 
 
 
307 aa  222  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  37.46 
 
 
305 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  40.2 
 
 
309 aa  221  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 
307 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  39 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  38.54 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>