More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3298 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
304 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
304 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  80.26 
 
 
304 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  75.25 
 
 
304 aa  497  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  72.28 
 
 
304 aa  478  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  66.12 
 
 
304 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0332  branched-chain amino acid aminotransferase  64.47 
 
 
304 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0235876  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  63.7 
 
 
304 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  65.68 
 
 
304 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10051  branched-chain amino acid aminotransferase  64.8 
 
 
304 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.299148 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  63.04 
 
 
304 aa  418  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  63.79 
 
 
305 aa  417  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  65.13 
 
 
304 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  64.69 
 
 
304 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14901  branched-chain amino acid aminotransferase  61.79 
 
 
306 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  41.89 
 
 
306 aa  245  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  42.14 
 
 
306 aa  245  8e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  42.23 
 
 
306 aa  245  8e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  41.89 
 
 
322 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  41.81 
 
 
302 aa  239  5e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  41.41 
 
 
305 aa  228  1e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  36.39 
 
 
303 aa  226  4e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  37.58 
 
 
311 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  38.51 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  39.41 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  38.64 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  37.79 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  37.04 
 
 
308 aa  218  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  37.21 
 
 
307 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  37.29 
 
 
307 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  37.29 
 
 
307 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  37.29 
 
 
307 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  36.54 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  36.54 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  36 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 
307 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  35.97 
 
 
312 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  37.29 
 
 
307 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  34.98 
 
 
312 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  36.54 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  36.82 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  36.21 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  36.21 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  36.21 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  36.21 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  36.21 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  36.21 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  36.21 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  37.17 
 
 
319 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  36.21 
 
 
306 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  33 
 
 
311 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  33.55 
 
 
306 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 
318 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  35.97 
 
 
313 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  36.42 
 
 
306 aa  193  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 
309 aa  193  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  35.31 
 
 
309 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 
313 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  35.22 
 
 
296 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  35.33 
 
 
312 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  34.98 
 
 
309 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  35.25 
 
 
302 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  34.1 
 
 
317 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  33 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 
307 aa  189  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  35.45 
 
 
307 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 
312 aa  188  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  33 
 
 
319 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  32.34 
 
 
306 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  36.12 
 
 
304 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 
307 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  35.05 
 
 
312 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  35.79 
 
 
304 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  34.67 
 
 
311 aa  186  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 
307 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  33 
 
 
308 aa  186  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  34.98 
 
 
306 aa  185  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
309 aa  185  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
309 aa  185  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
309 aa  185  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 
317 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
309 aa  185  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
309 aa  185  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
309 aa  185  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
309 aa  185  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0740  Branched-chain-amino-acid transaminase  35.28 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  32.78 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  33.66 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  34.43 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  33 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  35.97 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  33 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  32.69 
 
 
310 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1720  branched-chain amino acid aminotransferase  34.55 
 
 
316 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>