More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3033 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3033  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 317 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0183291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0408  branched-chain amino acid aminotransferase  42.48 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  43.91 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  44.23 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1720  branched-chain amino acid aminotransferase  41.29 
 
 		 316 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  40.78 
 
 		 307 aa  248  7e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  39.62 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  41.48 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  37.74 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  38.06 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  37.1 
 
 		 306 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  36.84 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3604  branched-chain amino acid aminotransferase  38.82 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  37.94 
 
 		 311 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  35.2 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  41.83 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  38.1 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  33.87 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  36.89 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  36.89 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  36.89 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  36.89 
 
 		 309 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  35.1 
 
 		 322 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  36.57 
 
 		 309 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  37.29 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  35.6 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  36.96 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  36.89 
 
 		 308 aa  202  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  36.66 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  35.92 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.63 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  35.62 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0147074 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  35.95 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  35.95 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  35.95 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  34.6 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  35.95 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  35.95 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  35.95 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  35.95 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  35.95 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  35.95 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  36.45 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  35.74 
 
 		 306 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  35.95 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  35.95 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  36.13 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  35.95 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  35.39 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  36.18 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  36.16 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  34.73 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  35.95 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  34.85 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  33.88 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  33.44 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  33.66 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  37.66 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  34.54 
 
 		 307 aa  188  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  34.26 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  37.42 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  33.44 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  34.3 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  34.09 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  34.98 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0347  branched-chain amino acid aminotransferase  32.89 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0855  branched-chain amino acid aminotransferase  34.21 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 		 304 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  34 
 
 		 309 aa  182  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2109  branched-chain amino acid aminotransferase  33.88 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  34.98 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  35.08 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0192  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.749275 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  34.62 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  32.72 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  34.32 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  33.55 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  32.67 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  32.79 
 
 		 304 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  35.62 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  36.6 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  32.46 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  33.01 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  32.41 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  31.61 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  33.99 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  32.13 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  32.91 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  32.56 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0296  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  32.89 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0318  branched-chain amino acid aminotransferase  32.89 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  34.3 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  33.77 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  33.99 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>