More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3604 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3604  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
311 aa  624  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1720  branched-chain amino acid aminotransferase  39.54 
 
 
316 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3033  branched-chain amino acid aminotransferase  38.82 
 
 
317 aa  223  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0183291 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  38.51 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  38.61 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  37.84 
 
 
306 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  37.5 
 
 
306 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  40.2 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  38.19 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  38.18 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  36.15 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  33 
 
 
302 aa  209  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0408  branched-chain amino acid aminotransferase  36.72 
 
 
303 aa  207  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  34.9 
 
 
322 aa  205  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
310 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  35.86 
 
 
306 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  36.45 
 
 
312 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  37.09 
 
 
308 aa  195  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  37 
 
 
308 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  36.45 
 
 
312 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  36.03 
 
 
304 aa  193  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  33.98 
 
 
305 aa  193  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  37.7 
 
 
308 aa  192  5e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  35.09 
 
 
322 aa  192  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  37.12 
 
 
319 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  37.42 
 
 
308 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  36.67 
 
 
309 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  36.67 
 
 
309 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  36.67 
 
 
309 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  36.67 
 
 
309 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0347  branched-chain amino acid aminotransferase  36.79 
 
 
309 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  37.42 
 
 
308 aa  189  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  35.53 
 
 
307 aa  188  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  31.85 
 
 
308 aa  188  9e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 
309 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 
309 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 
309 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 
309 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 
309 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  37.09 
 
 
308 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.12 
 
 
312 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  34.71 
 
 
308 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 
309 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 
309 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  42.09 
 
 
304 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  36.33 
 
 
309 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  36.33 
 
 
306 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 
309 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  35.76 
 
 
309 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  36.45 
 
 
307 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0192  branched-chain amino acid aminotransferase  33.44 
 
 
304 aa  186  6e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.749275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 
312 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  34.43 
 
 
303 aa  185  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  35.35 
 
 
304 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  36.88 
 
 
307 aa  185  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
307 aa  185  9e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  33.77 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  35.53 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  35.41 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  35.53 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  33.76 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  35.02 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  35.53 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  34.12 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  34.43 
 
 
303 aa  183  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  34.2 
 
 
303 aa  183  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  35.29 
 
 
307 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  34.12 
 
 
304 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  38.19 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  34.54 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  33.55 
 
 
312 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  36.16 
 
 
311 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 
309 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  33.44 
 
 
303 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  33.89 
 
 
313 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  35.22 
 
 
307 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  33.89 
 
 
307 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  35.55 
 
 
307 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  32 
 
 
312 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  36.79 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  32.67 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  35.97 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  32 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  34.42 
 
 
303 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  34.38 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  33.11 
 
 
303 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  34.64 
 
 
308 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  34.63 
 
 
307 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  36.45 
 
 
307 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  34.97 
 
 
306 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  36.45 
 
 
306 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  35.08 
 
 
307 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  37.79 
 
 
304 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  37.05 
 
 
312 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  35.08 
 
 
306 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  35.08 
 
 
307 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 
309 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>