More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_9 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 306 aa  635    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  97.71 
 
 		 306 aa  625  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  94.77 
 
 		 306 aa  614  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  53.31 
 
 		 311 aa  358  9e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  51.67 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  52.33 
 
 		 307 aa  348  7e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 		 322 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  50.67 
 
 		 310 aa  338  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  46.23 
 
 		 322 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  47.32 
 
 		 302 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  48.49 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  42.72 
 
 		 303 aa  288  1e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  43.71 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1720  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 316 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  41.25 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  42.57 
 
 		 307 aa  249  6e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0408  branched-chain amino acid aminotransferase  40.6 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  44 
 
 		 304 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  42.14 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  42.14 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  40.26 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  41.41 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  41.47 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 		 307 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  41.14 
 
 		 304 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  40.98 
 
 		 319 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  40.74 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  41.75 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  42.76 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  40.47 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  40.4 
 
 		 311 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  41.75 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  42 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  41.14 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.33 
 
 		 312 aa  235  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  40.68 
 
 		 306 aa  235  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  39.87 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  39.06 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  42.33 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  39.33 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  40.2 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  39.2 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  39.2 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  41.14 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  42.57 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  39.13 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  39 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  40.26 
 
 		 319 aa  232  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  41.33 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  38.03 
 
 		 305 aa  232  6e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  42.33 
 
 		 304 aa  232  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  38.54 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  40.47 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  41.12 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  37.87 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  37.87 
 
 		 307 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  41.2 
 
 		 312 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  42 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  41.67 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  38.21 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  38.69 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  38.36 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  39.67 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3033  branched-chain amino acid aminotransferase  37.1 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0183291 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  39 
 
 		 304 aa  228  8e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  41.61 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  38.21 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.86 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  40.74 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  37.87 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  37.21 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  40.4 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>