More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4800 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
304 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  80.26 
 
 
304 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  80.26 
 
 
304 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  70.72 
 
 
304 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  69.77 
 
 
304 aa  463  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  63.49 
 
 
304 aa  421  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0332  branched-chain amino acid aminotransferase  64.8 
 
 
304 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0235876  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10051  branched-chain amino acid aminotransferase  65.13 
 
 
304 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.299148 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  63.04 
 
 
304 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  63.04 
 
 
305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  63.37 
 
 
304 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14901  branched-chain amino acid aminotransferase  60.8 
 
 
306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  63.37 
 
 
304 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  63.04 
 
 
304 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  61.84 
 
 
304 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  41.53 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  44.04 
 
 
302 aa  252  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  44.33 
 
 
306 aa  251  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  41.86 
 
 
322 aa  248  9e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  43.33 
 
 
306 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  44 
 
 
306 aa  245  6e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  39.6 
 
 
310 aa  238  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 
307 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  41.25 
 
 
305 aa  236  3e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  39.33 
 
 
308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  37.95 
 
 
322 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  36.09 
 
 
303 aa  216  4e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  35.86 
 
 
303 aa  215  7e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  37.75 
 
 
305 aa  204  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 
307 aa  199  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  33.78 
 
 
308 aa  193  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  35.33 
 
 
304 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  34.8 
 
 
302 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  35.43 
 
 
318 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3033  branched-chain amino acid aminotransferase  37.66 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0183291 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  34.11 
 
 
309 aa  189  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  34.67 
 
 
304 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  35.91 
 
 
306 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1720  branched-chain amino acid aminotransferase  34.32 
 
 
316 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  35.88 
 
 
319 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  34.44 
 
 
307 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  35.23 
 
 
306 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  34.92 
 
 
312 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  34.44 
 
 
317 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  34.45 
 
 
307 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0192  branched-chain amino acid aminotransferase  34.9 
 
 
304 aa  185  7e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.749275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  33 
 
 
320 aa  185  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  33.44 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  34.44 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  34 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
312 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  33.89 
 
 
307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  33.12 
 
 
309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  33.12 
 
 
309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  33.12 
 
 
309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  37.63 
 
 
303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  33.12 
 
 
309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 
309 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 
309 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 
309 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 
309 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 
309 aa  182  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 
309 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 
309 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  33.67 
 
 
312 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 
309 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  34.54 
 
 
309 aa  182  7e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  33.22 
 
 
309 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  34.44 
 
 
309 aa  182  7e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  33.12 
 
 
319 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  32.32 
 
 
311 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  33.44 
 
 
307 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  35.23 
 
 
304 aa  181  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  33.89 
 
 
307 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  33.89 
 
 
307 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  32.57 
 
 
308 aa  181  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  32.04 
 
 
308 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0740  Branched-chain-amino-acid transaminase  33.88 
 
 
312 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  34.21 
 
 
309 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 
307 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 
307 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  32.89 
 
 
306 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  33.55 
 
 
307 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  33.55 
 
 
307 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  34 
 
 
313 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  32.79 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  32.55 
 
 
309 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  36.49 
 
 
303 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  33.55 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  34.53 
 
 
312 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>