More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0332 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0332  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 304 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0235876  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10051  branched-chain amino acid aminotransferase  99.34 
 
 		 304 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.299148 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  77.56 
 
 		 304 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  77.56 
 
 		 304 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  76.32 
 
 		 304 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  76.24 
 
 		 304 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14901  branched-chain amino acid aminotransferase  73.42 
 
 		 306 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  75.25 
 
 		 305 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  72.37 
 
 		 304 aa  484  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  72.94 
 
 		 304 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  66.78 
 
 		 304 aa  431  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  64.47 
 
 		 304 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  64.47 
 
 		 304 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  64.8 
 
 		 304 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  62.83 
 
 		 304 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  42.47 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  40.26 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  40.4 
 
 		 306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 308 aa  225  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  39.67 
 
 		 310 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 307 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  39.8 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  40.92 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 		 322 aa  222  7e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  40.92 
 
 		 306 aa  221  9e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  38.41 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  36.39 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  38.08 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  37.67 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  37.09 
 
 		 307 aa  192  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  35.16 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  36.67 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  36.33 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  36.33 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  36 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  36 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  35.83 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  38.02 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  35.67 
 
 		 307 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  34 
 
 		 306 aa  188  8e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  36.93 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  35.22 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  35.91 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  36.64 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  35.1 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  36.3 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  35.67 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  33.67 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  34.33 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  33.99 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  33.66 
 
 		 309 aa  185  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  35.55 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  33.11 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  33.11 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  36.88 
 
 		 303 aa  185  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  35.33 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  35.1 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  35.1 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  36.25 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  35.1 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  37.33 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  35.43 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  35.1 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  35.1 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  35.1 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  35.1 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  33.66 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  33.77 
 
 		 308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  37.37 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  33 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  33.88 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  37.71 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  33.99 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  35.31 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  36.27 
 
 		 307 aa  182  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  33.77 
 
 		 319 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  34.78 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  32.45 
 
 		 312 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  34.32 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  37.37 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  33.44 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  33.44 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  33.44 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  33.44 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  36.3 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  36.51 
 
 		 319 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  35.53 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  36.64 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  37.05 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  33.11 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  37.21 
 
 		 303 aa  178  8e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>