More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3128 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
318 aa  647    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  55.41 
 
 
322 aa  349  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  51.62 
 
 
308 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  52.79 
 
 
322 aa  329  4e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  53.14 
 
 
310 aa  325  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  52.51 
 
 
307 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  50.84 
 
 
306 aa  318  7.999999999999999e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  51.48 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 
306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  48.49 
 
 
306 aa  310  2e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  47.16 
 
 
302 aa  293  4e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  46.51 
 
 
305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  43.67 
 
 
303 aa  266  4e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  40.86 
 
 
303 aa  249  4e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  45.21 
 
 
320 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  37.09 
 
 
305 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  40.95 
 
 
311 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  41.83 
 
 
308 aa  227  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3033  branched-chain amino acid aminotransferase  41.83 
 
 
317 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0183291 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  40.13 
 
 
304 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  39.8 
 
 
304 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  39.8 
 
 
304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  38.16 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  41.45 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 
317 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  42.11 
 
 
307 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  38.44 
 
 
308 aa  212  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0567  branched-chain amino acid aminotransferase  41.03 
 
 
314 aa  211  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2457  branched-chain amino acid aminotransferase  40.63 
 
 
320 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  38.31 
 
 
309 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0893  branched-chain amino acid aminotransferase  40.63 
 
 
320 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2593  branched-chain amino acid aminotransferase  40.63 
 
 
320 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  36.42 
 
 
304 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  36.42 
 
 
304 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1720  branched-chain amino acid aminotransferase  40.5 
 
 
316 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0408  branched-chain amino acid aminotransferase  36.82 
 
 
303 aa  209  7e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.890044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  39.8 
 
 
306 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  40.68 
 
 
306 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  42.11 
 
 
307 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  39.07 
 
 
312 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  38.74 
 
 
312 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  37.58 
 
 
309 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  37.58 
 
 
309 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  37.58 
 
 
309 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  37.58 
 
 
309 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  37.86 
 
 
309 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  37.86 
 
 
309 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  37.86 
 
 
309 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  37.86 
 
 
309 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  37.86 
 
 
309 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  37.86 
 
 
309 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  37.26 
 
 
309 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.75 
 
 
312 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  37.86 
 
 
309 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  36.3 
 
 
304 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  35.76 
 
 
304 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  37.54 
 
 
309 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  39.27 
 
 
307 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  37.54 
 
 
309 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  35.53 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  40.13 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  36.3 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  37.66 
 
 
319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  37.34 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  37.99 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  38.94 
 
 
306 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  37.09 
 
 
319 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  39.46 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  38.08 
 
 
307 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  37.42 
 
 
307 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  36.09 
 
 
304 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  37.74 
 
 
308 aa  199  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  36.18 
 
 
305 aa  198  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  35.08 
 
 
308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  37.01 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  36.89 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  37.09 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  38.31 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  36.67 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  38.41 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  38.41 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  38.41 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  37.99 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  37.1 
 
 
318 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  37.54 
 
 
339 aa  197  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 
308 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  37.66 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  36.75 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.79 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  36.54 
 
 
307 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 
304 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  37.05 
 
 
308 aa  195  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  38.13 
 
 
310 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>