More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2033 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
304 aa  627  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2802  branched-chain amino acid aminotransferase  75.25 
 
 
304 aa  497  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3298  branched-chain amino acid aminotransferase  75.25 
 
 
304 aa  497  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.325063  normal  0.320727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  70.72 
 
 
304 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  72.94 
 
 
304 aa  468  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  66.12 
 
 
304 aa  421  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14901  branched-chain amino acid aminotransferase  65.46 
 
 
306 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  65.02 
 
 
304 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  65.02 
 
 
304 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  65.68 
 
 
304 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  64.69 
 
 
304 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08861  branched-chain amino acid aminotransferase  63.12 
 
 
305 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.399627  hitchhiker  0.00000896946 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09601  branched-chain amino acid aminotransferase  64.14 
 
 
304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0365373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10051  branched-chain amino acid aminotransferase  63.16 
 
 
304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.299148 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0332  branched-chain amino acid aminotransferase  62.83 
 
 
304 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0235876  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  41.69 
 
 
306 aa  238  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  42.03 
 
 
306 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  41.14 
 
 
306 aa  236  4e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  41.47 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  39.6 
 
 
302 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  40.74 
 
 
311 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  40.2 
 
 
322 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  37.12 
 
 
322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  38.51 
 
 
308 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  37.79 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  38.18 
 
 
310 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  38.1 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  36.27 
 
 
303 aa  208  9e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  36.54 
 
 
312 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  37.79 
 
 
307 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  36.67 
 
 
319 aa  192  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  35.95 
 
 
311 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  38.44 
 
 
302 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
307 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  37.75 
 
 
319 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  35.88 
 
 
306 aa  189  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  35.55 
 
 
307 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  36.54 
 
 
307 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 
312 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  34.45 
 
 
307 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  36.42 
 
 
307 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  35.57 
 
 
309 aa  185  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  36 
 
 
312 aa  185  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  34.55 
 
 
307 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  34.55 
 
 
307 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  35.67 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  36.09 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  36.09 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  36.09 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 
312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  35.02 
 
 
312 aa  182  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  35.33 
 
 
308 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  35.33 
 
 
308 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  34.88 
 
 
307 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  34.9 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  35.33 
 
 
308 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3128  branched chain amino acid aminotransferase  36.09 
 
 
318 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  35.57 
 
 
306 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  35.12 
 
 
308 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  36.61 
 
 
307 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  36.03 
 
 
308 aa  180  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  36.16 
 
 
320 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  35.25 
 
 
307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  33.89 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  34.56 
 
 
307 aa  179  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 
307 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  35.45 
 
 
307 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  34.55 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  36.58 
 
 
303 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  33.89 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0347  branched-chain amino acid aminotransferase  34.19 
 
 
309 aa  179  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  34.11 
 
 
309 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  34 
 
 
308 aa  179  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  34.11 
 
 
309 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  34.11 
 
 
309 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  34.11 
 
 
309 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  33.78 
 
 
309 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  33.78 
 
 
309 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  33.78 
 
 
309 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  33.78 
 
 
309 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  33.78 
 
 
309 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  33.78 
 
 
309 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  35.67 
 
 
311 aa  178  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  33.78 
 
 
309 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 
313 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  34.78 
 
 
308 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  35.22 
 
 
308 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  36.24 
 
 
303 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  33.78 
 
 
309 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  35.33 
 
 
306 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  33.44 
 
 
309 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  33.56 
 
 
306 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  33.44 
 
 
309 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  35.22 
 
 
308 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  32.23 
 
 
312 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  34.58 
 
 
296 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>