More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2300 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 
268 aa  551  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.84 
 
 
269 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.84 
 
 
269 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.84 
 
 
269 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  39.09 
 
 
269 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.37 
 
 
269 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.78 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.44 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.37 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.86 
 
 
267 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.37 
 
 
269 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.37 
 
 
269 aa  178  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.37 
 
 
269 aa  178  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  38.37 
 
 
269 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.37 
 
 
269 aa  178  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.55 
 
 
265 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.27 
 
 
265 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.68 
 
 
265 aa  175  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.44 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.13 
 
 
267 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  37.5 
 
 
278 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.67 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.33 
 
 
269 aa  165  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  35.86 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.81 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  35.51 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.21 
 
 
269 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.89 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  35.77 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  38.11 
 
 
273 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.47 
 
 
285 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.82 
 
 
282 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.11 
 
 
268 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.58 
 
 
271 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  34.98 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.14 
 
 
271 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.96 
 
 
271 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  33.7 
 
 
271 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  34.98 
 
 
269 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  33.06 
 
 
269 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  34.98 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.44 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34 
 
 
271 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.13 
 
 
268 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.08 
 
 
271 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  34.16 
 
 
269 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  34.16 
 
 
269 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  34 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.66 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  33.07 
 
 
277 aa  145  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  34.96 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.58 
 
 
271 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.87 
 
 
271 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.12 
 
 
277 aa  143  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.52 
 
 
271 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  30.18 
 
 
300 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.58 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  35.2 
 
 
305 aa  139  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  36.33 
 
 
296 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  32.78 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  33.46 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.1 
 
 
276 aa  135  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.6 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.49 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.08 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.33 
 
 
271 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  31.98 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  32.69 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  31.2 
 
 
271 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  29.72 
 
 
268 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  30.56 
 
 
295 aa  110  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  30.83 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  27.86 
 
 
277 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  27.86 
 
 
277 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  30.08 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09633  branched-chain amino acid aminotransferase  28.17 
 
 
279 aa  96.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.396462  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  27.85 
 
 
244 aa  96.3  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  29.91 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  26.97 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  26.8 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0121  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase-like protein  27.76 
 
 
326 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  28.85 
 
 
300 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  27.85 
 
 
244 aa  92  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  25.95 
 
 
282 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.57 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1632  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  27.07 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.114958  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  28.4 
 
 
269 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  28.41 
 
 
295 aa  90.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0580  aminotransferase class IV  26.92 
 
 
284 aa  89.4  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  29.72 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  30 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  24.9 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  29.72 
 
 
281 aa  87  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  30.36 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  25.29 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  26.69 
 
 
310 aa  85.9  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0141  aminotransferase, class IV  27.38 
 
 
278 aa  85.9  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  24.8 
 
 
277 aa  85.5  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>