More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2197 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 
271 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  95.57 
 
 
271 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  70 
 
 
271 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  67.41 
 
 
271 aa  354  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  65.31 
 
 
271 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  64.21 
 
 
271 aa  346  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  62.96 
 
 
271 aa  341  8e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  64.42 
 
 
271 aa  327  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  61.11 
 
 
271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  61.11 
 
 
271 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  61.11 
 
 
271 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  50.75 
 
 
273 aa  265  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  53.53 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.91 
 
 
276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  48.68 
 
 
270 aa  218  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  46.33 
 
 
271 aa  215  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  46.99 
 
 
288 aa  208  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.5 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.75 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  41.11 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  37.59 
 
 
278 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  45.24 
 
 
271 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  38.06 
 
 
271 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  43.02 
 
 
268 aa  169  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  38.43 
 
 
271 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  36.57 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.5 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.7 
 
 
269 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  35.96 
 
 
269 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40 
 
 
269 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.2 
 
 
265 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.33 
 
 
269 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.58 
 
 
268 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.09 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38 
 
 
267 aa  155  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  35.36 
 
 
269 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  35.36 
 
 
269 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  35.74 
 
 
269 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  35.36 
 
 
269 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  33.71 
 
 
269 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  36.33 
 
 
275 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 
296 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.27 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  35.61 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  37.14 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.6 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.1 
 
 
267 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.21 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.21 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  36.21 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.21 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  35.27 
 
 
295 aa  145  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  35.18 
 
 
277 aa  145  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.88 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.21 
 
 
269 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  41.2 
 
 
277 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  41.2 
 
 
277 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.85 
 
 
265 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.6 
 
 
282 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  35.8 
 
 
269 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  31.63 
 
 
300 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.73 
 
 
269 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.8 
 
 
269 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.73 
 
 
269 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.73 
 
 
269 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.36 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.33 
 
 
269 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  37.34 
 
 
269 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  32.28 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.36 
 
 
271 aa  132  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.92 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1632  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  31.83 
 
 
289 aa  126  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.114958  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  34.16 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  30.15 
 
 
291 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  31.91 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  37.9 
 
 
272 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  27.8 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  39.23 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  34.15 
 
 
300 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  31.95 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  31.52 
 
 
282 aa  109  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  28.09 
 
 
299 aa  108  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  28.46 
 
 
299 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  28.09 
 
 
299 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  28.46 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  28.46 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  28.46 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  28.46 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  28.46 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
307 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  28.09 
 
 
299 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  28.46 
 
 
299 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  34.72 
 
 
310 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  27.9 
 
 
292 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 
287 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 
281 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  28.09 
 
 
298 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>