More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1590 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 
267 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  76.4 
 
 
267 aa  428  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  66.42 
 
 
265 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  66.79 
 
 
265 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  58.87 
 
 
265 aa  328  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  62.26 
 
 
268 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  61.51 
 
 
268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  61.13 
 
 
268 aa  325  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53.38 
 
 
269 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53.76 
 
 
269 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53.76 
 
 
269 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53.76 
 
 
269 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53.38 
 
 
269 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53.38 
 
 
269 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  52.63 
 
 
269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  52.63 
 
 
269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  53.01 
 
 
269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  52.63 
 
 
269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  52.63 
 
 
269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  52.63 
 
 
269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  52.26 
 
 
269 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  51.88 
 
 
269 aa  277  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  54.89 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.86 
 
 
267 aa  256  3e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.25 
 
 
268 aa  225  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  43.8 
 
 
271 aa  219  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.7 
 
 
271 aa  192  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  35.66 
 
 
271 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  38.76 
 
 
278 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  40.77 
 
 
271 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.99 
 
 
277 aa  182  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  41.6 
 
 
277 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.13 
 
 
268 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 
269 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  37.65 
 
 
269 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  37.65 
 
 
269 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.74 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  36.03 
 
 
269 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  37.65 
 
 
269 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  36.44 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  36.44 
 
 
269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  37.25 
 
 
269 aa  165  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.15 
 
 
269 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.92 
 
 
271 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  39.36 
 
 
296 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.91 
 
 
271 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  35.69 
 
 
273 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  38.84 
 
 
294 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  37.65 
 
 
271 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.26 
 
 
271 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  35.44 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.1 
 
 
271 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.96 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  34.65 
 
 
277 aa  145  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  39.27 
 
 
285 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.19 
 
 
271 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  37.1 
 
 
275 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.3 
 
 
271 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  32.72 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.12 
 
 
282 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.95 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  36.21 
 
 
288 aa  139  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.54 
 
 
271 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.74 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.12 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  29.5 
 
 
295 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  34.15 
 
 
269 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.01 
 
 
270 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.63 
 
 
268 aa  122  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  34.68 
 
 
277 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  34.68 
 
 
277 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.75 
 
 
271 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  27.07 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  30.62 
 
 
298 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  31.5 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  26.85 
 
 
293 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  27.63 
 
 
292 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  27.64 
 
 
288 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  30.04 
 
 
310 aa  102  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  31.8 
 
 
291 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  25.82 
 
 
297 aa  102  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  27.64 
 
 
347 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  28.46 
 
 
297 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.69 
 
 
277 aa  99.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  26.09 
 
 
281 aa  99  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  26.09 
 
 
287 aa  98.6  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1632  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  30.94 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.114958  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  25.1 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  26.12 
 
 
299 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  33.96 
 
 
264 aa  95.5  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  24.51 
 
 
292 aa  95.5  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  32.98 
 
 
305 aa  94.7  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  26.27 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  26.91 
 
 
303 aa  93.2  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  25.3 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  27.39 
 
 
298 aa  92.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0329  aminotransferase, class IV  35.33 
 
 
315 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  27.39 
 
 
298 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  27.39 
 
 
298 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  27.39 
 
 
298 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>