More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1734 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  100 
 
 
269 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  97.03 
 
 
269 aa  531  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  96.65 
 
 
269 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  86.62 
 
 
269 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  76.95 
 
 
269 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  76.95 
 
 
269 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  76.21 
 
 
269 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  76.21 
 
 
269 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  75.84 
 
 
269 aa  418  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  56.62 
 
 
277 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  52.99 
 
 
271 aa  285  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  55.6 
 
 
271 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  55.19 
 
 
294 aa  276  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  50.55 
 
 
277 aa  265  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  47.47 
 
 
300 aa  258  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  44.11 
 
 
296 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  40.89 
 
 
285 aa  185  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.08 
 
 
265 aa  185  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.62 
 
 
265 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  41.53 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.94 
 
 
268 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.08 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  36.43 
 
 
273 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.58 
 
 
269 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  37.36 
 
 
271 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.6 
 
 
271 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.65 
 
 
267 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.2 
 
 
271 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.76 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.86 
 
 
267 aa  165  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.45 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.96 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  37.74 
 
 
269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.2 
 
 
271 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.35 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.35 
 
 
269 aa  162  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.7 
 
 
271 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.96 
 
 
269 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  36.96 
 
 
269 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.96 
 
 
269 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.96 
 
 
269 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.92 
 
 
268 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.64 
 
 
271 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.09 
 
 
277 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.7 
 
 
270 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  36.92 
 
 
278 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.02 
 
 
269 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.11 
 
 
268 aa  158  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.02 
 
 
269 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.96 
 
 
269 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.02 
 
 
269 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.02 
 
 
269 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.54 
 
 
268 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.36 
 
 
271 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.58 
 
 
269 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.98 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.43 
 
 
267 aa  154  1e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.77 
 
 
271 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.4 
 
 
271 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.59 
 
 
271 aa  151  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.02 
 
 
271 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.64 
 
 
271 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  33.85 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.87 
 
 
271 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1632  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.68 
 
 
289 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.114958  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  35.21 
 
 
268 aa  138  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.47 
 
 
282 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  32.68 
 
 
275 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  35.04 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  32.6 
 
 
269 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  34.03 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  37.04 
 
 
272 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  31.62 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  32.75 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  27.7 
 
 
298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  29.56 
 
 
296 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  33.21 
 
 
270 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  31.01 
 
 
263 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  27.73 
 
 
281 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  27.73 
 
 
287 aa  99.8  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.44 
 
 
266 aa  99.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  27.88 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
286 aa  95.5  8e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  28.2 
 
 
288 aa  95.5  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  26.57 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  28.9 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  29.44 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
282 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 
299 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  31.97 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  29.84 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  31.97 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  27.92 
 
 
299 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  30.22 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 
286 aa  92  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  30.22 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.47 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  25.28 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  27.55 
 
 
299 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>