More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2216 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 269 aa  554  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  77.7 
 
 		 269 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  77.32 
 
 		 269 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  76.58 
 
 		 269 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  76.58 
 
 		 269 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  75.84 
 
 		 269 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  75.84 
 
 		 269 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  75.84 
 
 		 269 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  75.84 
 
 		 269 aa  418  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  52.61 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  56.25 
 
 		 277 aa  290  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  55.6 
 
 		 271 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  53.7 
 
 		 294 aa  275  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  47.14 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  49.82 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  45.25 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.75 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.55 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.3 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  42.45 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  39.3 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.63 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.91 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.91 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.91 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.91 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  38.91 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.85 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.16 
 
 		 265 aa  178  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.52 
 
 		 269 aa  178  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  34.57 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.52 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  39.11 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.18 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  38.65 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.97 
 
 		 269 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 269 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.97 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.97 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.25 
 
 		 267 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.65 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.21 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.09 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.62 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.34 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.51 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.11 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.33 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.7 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.21 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.65 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.06 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.53 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.14 
 
 		 282 aa  153  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  32.45 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.32 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.32 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.71 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.47 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  32.68 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  35.45 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.58 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.7 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.56 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  29.7 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1632  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  35.21 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.114958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  34.16 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.19 
 
 		 271 aa  121  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  31.15 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  31.02 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  30.51 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  31.36 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  28.67 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  29.14 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  29.76 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  28.89 
 
 		 310 aa  99.4  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  28.63 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  28.24 
 
 		 299 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  29.81 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  30.08 
 
 		 286 aa  96.7  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  31.12 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  29.3 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  28.95 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  27.31 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  27.31 
 
 		 299 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  26.17 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  30.29 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  26.17 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  27.31 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  28.25 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 		 299 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 		 299 aa  89.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 		 299 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 		 299 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 		 299 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 		 299 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  26.92 
 
 		 299 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  31.64 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>