More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0760 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 296 aa  557  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  43.42 
 
 		 282 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  42.42 
 
 		 298 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  37.88 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  39.18 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  38.06 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  38.49 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  38.06 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  38.06 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  38.06 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  38.06 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  38.06 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  38.06 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  38.06 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  38.06 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  45.14 
 
 		 269 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  38.38 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  41.83 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  34.75 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  38.38 
 
 		 290 aa  175  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  36.2 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  35.84 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  35.56 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  35.48 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 293 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  35.48 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  35.48 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  35.48 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  35.48 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  35.48 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  35.48 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  37.97 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  35.48 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  39.34 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  37.45 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  35.58 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  37.5 
 
 		 282 aa  169  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  47.21 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  36.09 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  40.65 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  35.58 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  36.74 
 
 		 288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  38.02 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  38.43 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  35.82 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  36.84 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  42.7 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  36.09 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  34.83 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  36.09 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  36.98 
 
 		 297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  44.49 
 
 		 285 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.79 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  40.08 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  38.06 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  37.6 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  38.7 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  32.98 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  43.45 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  40.38 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  42.8 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.55 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  36.72 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  42.8 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  29.6 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  37.87 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  29.6 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  37.55 
 
 		 264 aa  143  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  35.63 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  44.09 
 
 		 283 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  31.97 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  36.94 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.02 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  33.92 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.42 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  35.42 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  33.58 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  32.2 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  37.22 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  32.21 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.71 
 
 		 282 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  36.26 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  38.38 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.55 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.04 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50806  predicted protein  32.36 
 
 		 588 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  34.98 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  28.63 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  36.65 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.23 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  37.1 
 
 		 270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  31.46 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  33.21 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  34.53 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.08 
 
 		 276 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  36.33 
 
 		 298 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  32.2 
 
 		 287 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>