More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2898 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 270 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  47.66 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  37.45 
 
 		 298 aa  161  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  38.91 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  41.6 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.08 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  42.19 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  42.08 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  42.08 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  43.02 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  34.7 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  32.23 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.25 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  37.21 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  32.23 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  30.88 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1295  aminotransferase class-IV  30.8 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.326181  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29691  aminotransferases class-IV  34.59 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  37.45 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  40.3 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  38.7 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  33.84 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  34.24 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  38.32 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  39.69 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  30.49 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  30.94 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.1 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.85 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18841  aminotransferases class-IV  26.85 
 
 		 275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  30.94 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  30.94 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  30.94 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  30.94 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  36.05 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  28.03 
 
 		 299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  30.49 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  31.92 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  40.47 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  27.65 
 
 		 299 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  27.65 
 
 		 299 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  27.65 
 
 		 299 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  27.65 
 
 		 299 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  27.65 
 
 		 299 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  30.49 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  30.49 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  30.77 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  27.65 
 
 		 299 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  30.15 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  27.65 
 
 		 299 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  30.49 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  30.49 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  31.3 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19031  aminotransferases class-IV  26.07 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35016  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 		 286 aa  106  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 299 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18261  aminotransferase class-IV  29.48 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  33.07 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1786  aminotransferase class-IV  24.12 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.285091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  29.59 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  35.5 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  31.11 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.46 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  29.06 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  30.19 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.66 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  34.93 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  32.56 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  28.84 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  26.52 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  31.44 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.21 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.08 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  30.6 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.9 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.28 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.59 
 
 		 290 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  29.61 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  33.97 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.78 
 
 		 290 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  28.14 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  31.7 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  31.15 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  30.8 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  31.95 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  33.49 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.78 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  32.54 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  32.59 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  32.12 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  30.38 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.59 
 
 		 290 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.59 
 
 		 290 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.41 
 
 		 285 aa  95.5  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  32.31 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  29.77 
 
 		 288 aa  95.5  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.2 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>