More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1786 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1786  aminotransferase class-IV  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.285091  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19031  aminotransferases class-IV  91.27 
 
 		 275 aa  510  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35016  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18841  aminotransferases class-IV  89.45 
 
 		 275 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18841  aminotransferases class-IV  64 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  47.01 
 
 		 275 aa  235  7e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1295  aminotransferase class-IV  46.27 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.326181  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18261  aminotransferase class-IV  39.19 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  37.36 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29691  aminotransferases class-IV  38.15 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  34.8 
 
 		 270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  24.12 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  27.13 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  24.25 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  27.14 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  31.12 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  31.12 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  23.88 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  24.79 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.1 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  24.05 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  24.6 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  26.51 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  27.31 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  26.85 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.23 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  25.47 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  23.53 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.91 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  23.11 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  22.75 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  26.84 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  25 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  25 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  23.11 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  23.92 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  24.53 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  24.88 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  24.64 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  24.4 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  26.67 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  26.32 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.17 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  24.69 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  24.43 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  25.1 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  26.67 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  25.3 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  25.3 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  25.3 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  25.3 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  25.3 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  25.3 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  26.7 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  25.3 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  23.11 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  24.9 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  25.3 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  23.98 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  26.05 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.64 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1220  aminotransferase class IV  26.98 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  24.9 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  26.32 
 
 		 292 aa  62  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  32.8 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  27.16 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.99 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  23.35 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1302  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.42 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0291575  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  24.62 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  26.75 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  24.62 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  26.75 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  26.75 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  26.75 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.86 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  23.48 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.25 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.86 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.65 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  24.33 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  26.75 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  26.75 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  31.22 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  23 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  25 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.04 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  26.34 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.86 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.59 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  26.53 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  24.34 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  26.53 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  19.57 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  23.24 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  24.5 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.38 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  21.13 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  22.17 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  22.58 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  20.7 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>