More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1295 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1295  aminotransferase class-IV  100 
 
 		 275 aa  553  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.326181  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  98.18 
 
 		 275 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29691  aminotransferases class-IV  51.29 
 
 		 286 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18261  aminotransferase class-IV  53.68 
 
 		 276 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  48.5 
 
 		 270 aa  279  4e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  48.5 
 
 		 270 aa  278  7e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18841  aminotransferases class-IV  46.64 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19031  aminotransferases class-IV  45.9 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1786  aminotransferase class-IV  46.27 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.285091  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18841  aminotransferases class-IV  46.24 
 
 		 275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  35.18 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  30.8 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  30.31 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  30.74 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  32.27 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  26.94 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  31.15 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  31.53 
 
 		 298 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  32.29 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  31.53 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  31.53 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  31.53 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  31.53 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  31.53 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  31.53 
 
 		 298 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  30.8 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  31.53 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  31.53 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  31.82 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.92 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  29.8 
 
 		 286 aa  95.5  8e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  28.24 
 
 		 288 aa  95.5  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  28.3 
 
 		 276 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  28.9 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  31.82 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  30.84 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  26.52 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  29.03 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  27.82 
 
 		 280 aa  92.4  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  29.73 
 
 		 293 aa  92.4  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  27.41 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  31.05 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  29.29 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  29.33 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  28.35 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  31.45 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  27.7 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  30.59 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.93 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  26.49 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  28.72 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  31.05 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  26.1 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  26.55 
 
 		 293 aa  86.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  27.65 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  27.65 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  31.25 
 
 		 295 aa  85.9  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  27.17 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  28.97 
 
 		 286 aa  85.5  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  27.17 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  26.44 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  27.76 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  25 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  27.38 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  28.68 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.84 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  27.38 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  31.23 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  27.76 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  29.2 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  29.41 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.92 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  25.1 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  24.52 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.66 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  25.19 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.55 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  27.65 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  25.37 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  29.65 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  25.35 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  23.74 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  28 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  26.82 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  26.79 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  28.44 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  28.09 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  27.98 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  28.38 
 
 		 741 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  25 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  23.92 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>