More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29691 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_29691  aminotransferases class-IV  100 
 
 
286 aa  583  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  51.29 
 
 
275 aa  308  5e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1295  aminotransferase class-IV  51.29 
 
 
275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.326181  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18261  aminotransferase class-IV  50.72 
 
 
276 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  56.04 
 
 
270 aa  301  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  56.04 
 
 
270 aa  287  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18841  aminotransferases class-IV  38.89 
 
 
275 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19031  aminotransferases class-IV  39.26 
 
 
275 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.35016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1786  aminotransferase class-IV  38.15 
 
 
275 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.285091  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18841  aminotransferases class-IV  36.67 
 
 
275 aa  198  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  34.98 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  34.59 
 
 
270 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  30.71 
 
 
288 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  29.59 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  33.33 
 
 
269 aa  99.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  31.44 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  32.68 
 
 
287 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  27.37 
 
 
276 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  26.87 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  32.41 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  28.88 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  31.56 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  32.16 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  31.28 
 
 
282 aa  89.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  26.44 
 
 
280 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  29.31 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  30.32 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  29.77 
 
 
741 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  29.2 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  29.2 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  29.2 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  29.2 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  29.2 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  28.44 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  28.88 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  28.44 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.88 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  30.09 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  26.95 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  28.44 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  28.44 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  27.97 
 
 
274 aa  82  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  26.74 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  27.56 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  27.27 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  26.88 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  25.68 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  31.99 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  24.82 
 
 
292 aa  79  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  27.04 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  28.57 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  27.44 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.12 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  27.1 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  25.74 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  26.04 
 
 
299 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  26.34 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  26.04 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  26.04 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.75 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  26.04 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  26.04 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  26.04 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  26.04 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.75 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  29.25 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  26.04 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.75 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  26.04 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  28.75 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.28 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.75 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  25.91 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.86 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  29.95 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  29.13 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.1 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.72 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  28.75 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  25.28 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  26.64 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  24.54 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  27.88 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.28 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  25.69 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.52 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  32.42 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  30.41 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.96 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  29.95 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.89 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  27.23 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  28.78 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  24.55 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  27.13 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  26.04 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.18 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  24.18 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>