More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3581 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  100 
 
 
263 aa  494  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  58.37 
 
 
288 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  49.59 
 
 
269 aa  195  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  42.7 
 
 
298 aa  192  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  37.74 
 
 
287 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  44.09 
 
 
270 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  37.35 
 
 
281 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  47.76 
 
 
296 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  40.22 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  39.92 
 
 
264 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  36.26 
 
 
293 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  37.02 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  36.09 
 
 
288 aa  146  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  37.69 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  37.69 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  38.08 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  38.08 
 
 
298 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  38.08 
 
 
298 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  38.08 
 
 
298 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  38.08 
 
 
298 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.08 
 
 
266 aa  145  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  37.69 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  37.69 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  43.08 
 
 
287 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  37.69 
 
 
298 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  35.94 
 
 
287 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  37.16 
 
 
288 aa  142  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  36.33 
 
 
287 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  35.66 
 
 
287 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  45.19 
 
 
283 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  35.77 
 
 
299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  34.22 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  39.67 
 
 
280 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  35.8 
 
 
291 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  37.02 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  47.06 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  36.89 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  33.72 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  42.32 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  42.32 
 
 
285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  37.08 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  37.7 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  34.11 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 
286 aa  132  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  36.74 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  36.84 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  38.22 
 
 
280 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  37.07 
 
 
297 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  34.23 
 
 
299 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  35.18 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  34.29 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4200  aminotransferase class IV  45.2 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108763  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  38.67 
 
 
278 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.55 
 
 
270 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  41.04 
 
 
285 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  33.08 
 
 
293 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  38.22 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  33.08 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 
299 aa  125  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  35.39 
 
 
295 aa  125  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 
299 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 
299 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  38.11 
 
 
285 aa  125  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  40.62 
 
 
288 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.74 
 
 
271 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  33.08 
 
 
299 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  31.8 
 
 
288 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.08 
 
 
277 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  36.43 
 
 
271 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.74 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  33.98 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.77 
 
 
290 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  36.16 
 
 
307 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  35.14 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  31.78 
 
 
269 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  34.04 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  35.25 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.08 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  32.26 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  36.73 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  32.43 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  32.26 
 
 
271 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  32.51 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  35.24 
 
 
273 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  31.78 
 
 
269 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  38.21 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  35.8 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  35.43 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  30.92 
 
 
269 aa  113  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.15 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  36.36 
 
 
277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  31.01 
 
 
269 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  35.71 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>