More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4200 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4200  aminotransferase class IV  100 
 
 		 255 aa  494  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  45.2 
 
 		 282 aa  191  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.31 
 
 		 266 aa  168  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  51.06 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  36.89 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  43.08 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  36.21 
 
 		 287 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  36.21 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  45.2 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  44.11 
 
 		 285 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  44.11 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  42.04 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  44.11 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  45.49 
 
 		 296 aa  131  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.17 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  27.02 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  39.33 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.05 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  27.71 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  30.56 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  30.56 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  36.44 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  35.86 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.28 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  34.94 
 
 		 297 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  38.89 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  34 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  32.82 
 
 		 295 aa  115  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.46 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  37.12 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  36.44 
 
 		 291 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  32.33 
 
 		 293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  32.82 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  40.49 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  33.98 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  37.25 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  47.13 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.96 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  35.1 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  33.61 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29.63 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  29.63 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  37.45 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  29.63 
 
 		 298 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  29.63 
 
 		 298 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.89 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  29.63 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  29.63 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  29.63 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  29.63 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.63 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  29.26 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  29.81 
 
 		 291 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  32.43 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  34.01 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.46 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  37.39 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.99 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.02 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  35.25 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.15 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  35.9 
 
 		 307 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.41 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.83 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  36.92 
 
 		 307 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.46 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  31.52 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  35.77 
 
 		 288 aa  105  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.99 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  30.94 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.15 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.83 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  31.98 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  31.1 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.64 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.83 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.83 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.83 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  37.6 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.77 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  35.48 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.24 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  29.62 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  37.15 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  32.06 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  35.44 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.26 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.91 
 
 		 269 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  30.8 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.13 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  32.71 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  34.48 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>